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原因有以下幾點。
第一，醫院的處方藥比較多。
在我國，藥品分為處方藥和非處方藥。處方藥物只能憑醫生為病人開具的處方購買和使用，而且這類處方藥物需要在醫生的指導下使用。
一般病人繳費過後，是直接去醫院的藥房拿藥，很少有病人持處方到院外買藥，且一般社會性藥房中的處方藥很少。所以醫生開的藥一般很難在社會性藥房買到。
第二，醫院的藥物品種比較全
特別是綜合性醫院，科室比較多，診治的疾病種類更多，所以要求藥品的種類也相應的多。有些藥物時針對性某種疾病有較好的效果，但是這種疾病比較罕見或者少見。如果社會性藥房購進這種藥物，很難銷售出去，所以就不會賣。
第三、有些特殊藥物只能在醫院買到
這類藥物，比如說麻醉藥品，精神藥品，醫療用毒性藥品等以及造影劑。這些比較特殊的藥品，只能在有資質的醫院使用，有些級別比較低的醫院甚至連這些藥品都不能購進和使用，更別說社會性藥房了。
第四、急救藥品
用於搶救病人的藥品，一般只有醫院採用，比如說腎上腺素，阿托品，碘解磷定，洛貝林，尼可剎米，多巴胺等。這些藥品的使用需要在非常有經驗的醫生指導下使用，護士來執行。而社會性藥房沒不具備購進這些藥品的條件。
第五，抗腫瘤藥物
很多的抗腫瘤藥物，比如曲妥珠單抗，鉑類，利妥昔單抗，表柔比星等，都是注射劑型，只有住院患者才能使用。有些口服劑型的抗腫瘤藥物，有極少的藥店也有賣，但很少。
第六，利潤低的藥物
社會性藥房是以賺錢為主的，有些利潤比較低的藥物就不會購進和銷售了。但是醫院要配備國家基本藥物，特別是公立醫院。且如今藥品是零差價銷售，醫院是優先考慮價格低，且具有同樣效果的藥品。
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