1評分實行百分制
高新技術企業評分實行百分制， 71分及以上為合格，對核心自主知識產權、科技成果轉化能力、研究開發的組織管理水平、成長性指標等四個方面內容進行打分。
2重點檢查
認定成功後，科技部、財政部、稅務總局按照《高新技術企業認定管理辦法》的要求，可組織專家對各地高新技術企業認定管理工作進行重點檢查，對存在問題的視情況給予相應處理。
3企業年報
企業獲得高新技術企業資格後，在其資格有效期內應每年 5 月底前通過“高新技術企業認定管理工作網”，報送上一年度知識產權、科技人員、研發費用、經營收入等年度發展情況報表；在同一高新技術企業資格有效期內，企業累計兩年未按規定時限報送年度發展情況報表的，由認定機構取消其高新技術企業資格，在“高新技術企業認定管理工作網”上公告。
4複核
對已認定的高新技術企業，有關部門在日常管理過程中發現其不符合認定條件的，應以書面形式提請認定機構複核。複核後確認不符合認定條件的，由認定機構取消其高新技術企業資格，並通知稅務機關追繳其不符合認定條件年度起已享受的稅收優惠。
5其他
認定成功後有《高新技術企業認定管理辦法》第十九條所列三種行為之一的企業，自行為發生之日所屬年度起取消其高新技術企業資格，並在“高新技術企業認定管理工作網”上公告。已認定的高新技術企業，無論何種原因被取消高新技術企業資格的，當年不得再次申請高新技術企業認定。
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