呼倫貝爾被稱作野生動物的樂園，這裡的野生動物品種和數量繁多。全市有野生動物4綱29目83科489種，佔自治區的68.92％，居第一位。在這些動物中，受國家保護的一、二級野生動物和受自治區保護的野生動物品種有81種。主要分佈在大興安嶺森林、呼倫貝爾草原和湖泊一帶。依其經濟價值，大體可分為毛皮、藥用、食用三大類。
野生裘皮毛動物主要有水獺、旱獺、黃鼬、猞猁、赤狐、貂、松鼠、草兔、馴鹿、黃羊等。
藥用類野生動物主要有馬鹿、駝鹿、麝、狐狸、蒙古兔、黃鼬、黃羊、獾等，其中以鹿科動物的最為有名。
全市共有鳥類328種，受國家保護的鳥類60多種，如丹頂鶴、白鶴、灰鶴、白鸛、大天鵝、蓑羽鶴等。
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