辣椒定植宜在晴天進行，有利於辣椒根系的生長成活。因這時天氣溫度還較高，栽苗後出現某種程度的暫時萎蔫現象，是正常的。陰雨天氣栽苗，植株雖然不萎蔫，但土溫低，加上栽苗時人為的活動，易造成土壤板結，不利於髮根，成活率低。所以晴天栽苗緩苗快，陰雨天栽苗緩苗慢。辣椒定植時應注意以下幾點水肥管理和病蟲防控：
1、施用腐熟有機肥：定植前一段時間，做好施用優質腐熟有機肥，讓有機肥充分發酵腐熟，可減少有機肥料未腐熟而施入土壤中造成的蟲害、氣害及燒根燒苗現象。
2、浸泡穴盤田壟消毒：定植前浸泡穴盤並對田壟噴藥、灌穴消毒，保證辣椒在定植後緩苗快，根系發達，植株健壯，可用72.2%霜黴威水劑750倍液，精甲霜靈1500倍液，加入25%噻蟲嗪水分散粒劑2500-5000倍液等進行穴盤浸泡處理，可提高植株抵抗能力，促進植株生長，同時可防治苗期蟲害。
3、掌握定植深度：辣椒定植深度不宜過深過淺，過淺露坨不易緩苗，太深容易造成根部腐爛死苗。辣椒定植取苗前，先對辣椒苗澆透水，使辣椒苗儘量多帶泥土，並注意減少根部的損傷。辣椒栽植深度以幼苗子葉齊土為宜，定植後立即澆足定根水。
4、定植後灌根殺菌：在澆定根水時可選擇氫氧化銅、喹啉銅等藥劑中的一種，加入甲霜靈或吡唑醚菌酯或惡霜靈錳鋅等藥劑進行灌根，每棵灌藥200-300克為宜。
5、提倡起壟栽培：若平畦栽培，則需要進行培土，並注意培土不宜過深，澆水時以不超過培土位置為宜，可防止植株壞棵現象。
6、狠促根，穩促秧：定植後到初果期是辣椒田間管理的前期。管理上要促根、促秧、促發棵。定植後3-5天澆緩苗水，水量稍大些，但一定不能超過壟面，因辣椒根系不發達，超過壟面容易產生澇害傷苗，造成死亡。水滲後地皮發乾可操作時，要抓緊進行中耕，可提高地溫1攝氏度左右。澆過緩苗水後，再過5-6天澆第二次緩苗水，促根下扎。隨後本著近根處要淺、遠根處要深的原則，深鋤7釐米，鋤透推細。這次中耕後蹲苗半月左右，通過控水蹲苗防止植株徒長。
第一次蹲苗結束後，澆第三次水，促進花芽分化，隨即再中耕，轉入第二次蹲苗，時間也是半個月左右。蹲苗掌握適度，不能過頭。自第二次蹲苗開始後半個月，植株分生出許多短枝，果實也迅速生長，這時必須及時補充含有機活化營養、磷、鉀、鈣、硼等礦質營養的肥，追肥後結合中耕培土保護根系，防止倒伏。
7、注意做好排灌水工作：遇高溫乾旱，見土壤發白時必須灌水；遇連續陰雨連綿，要注意清溝排水，以免受澇，漚根死苗。
8、及時提膜降溫：遇到高溫天氣，對辣椒避雨栽培模式，要及時提膜降低棚內溫度和溼度，防止辣椒徒長。
9、及時培土：可分3次培土，有利於降低地下水位，抗倒伏爭高產。
10、中耕除草：俗話說，“中耕鋤地把臺留，辣椒結得大又稠”、“鋤地把根動，易得椒瘋病”。中耕要嚴格掌握頭遍淺、二遍深、三遍不傷根，頭遍淺鋤、二遍用鋤壅、三遍鋤草把壟封的原則。就是說移栽后土壤板結，要淺鋤1-2次，植株發棵打頂後要鋤1次。
11、搞好遮陰：實踐證明，辣椒喜歡半遮陰的立地條件，在玉米半遮陰帶裡生長情況比大田單作還好，其落葉率低、發病少、結果率高，沒有花皮椒，單果重、單株產量比常規種植高20%左右，果實著色成熟較晚。因此，可大力推廣玉米、辣椒間作套種，即每種6行辣椒套種1行玉米，每穴玉米2-3株，穴距50釐米，這樣小辣椒不少收，玉米每畝收250-300公斤。
12、防病治蟲：辣椒主要病害是疫病、炭疽病，主要害蟲是棉鈴蟲。除農業防治外，預防病害藥劑炭疽病：建議溴菌腈或者苯醚甲環唑丙環唑或者咪鮮胺錳鹽或者咪鮮胺或者二氰蒽醌或者吡唑醚菌酯等。預防為主，綜合防治。交替使用農藥成分，不要連續使用一樣的農藥成分。
這是植保原則。疫病各地抗性不同。建議烯酰嗎啉，霜脲錳鋅，霜黴威鹽酸鹽，甲霜靈錳鋅，惡霜靈錳鋅，氟嗎啉錳鋅，氰霜唑，氟醚菌酰胺選擇一個或者二個混合，交替使用。大棚注意控制溼度，陰雨天溼度大建議使用百菌清煙霧劑控制病情。預防為主，綜合防治。交替使用農藥成分，不要連續使用一樣的農藥成分。棉鈴蟲建議使用氯蟲苯甲酰胺、甲維鹽、阿維菌素-毒死蜱混合藥劑與生物防治措施交替運用，效果較好。
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