“怪物大軍之夜篇”這個故事是重生時期蝙蝠俠各刊的第一次聯動。也就是說，這個故事即是蝙蝠俠的故事線，也是夜翼的故事。這個故事分為6話連載。按照內容先後分別是：
- “怪物大軍之夜篇” ①《蝙蝠俠》V3第7話
- “怪物大軍之夜篇”②《夜翼》V4第5話
- “怪物大軍之夜篇”③《偵探漫畫》第941話
- “怪物大軍之夜篇”④《蝙蝠俠》V3第8話
- “怪物大軍之夜篇”⑤《夜翼》V4第6話
- “怪物大軍之夜篇”⑥《偵探漫畫》第942話
怪物大軍來襲
一場特大暴風雨將要襲擊哥譚市，蝙蝠家族的蝙蝠俠、蝙蝠女俠、夜翼和掠奪者小隊正在疏散災區的民眾，可是沒想到一個特大的怪物跑了出來。蝙蝠俠制服了它，但是另外一隻怪物又出現了。艾爾弗雷德報告了這些怪物的DNA：這種病毒細胞壓制了正常的人類組織，並且按照自己的形象進行了重建，它們可以自我編程，侵襲性極高，鑑別催化劑是研究抗療的關鍵。原來這些都是死人經過細胞增生變化的，蝙蝠俠和蝙蝠女俠對付怪物，並讓夜翼去停屍間查找線索。
夜翼找到了線索
在停屍間，夜翼發現了丟失的四具屍體，還有十幾具蛹，裡面的生化人很可能破繭而出。哥譚市黑門監獄又出現了一個怪物，夜翼趕往那裡，卻不想哥譚女也重新披上戰袍，飛向那裡。蝙蝠女俠告誡哥譚女她還受到心靈海盜的影響，不要盲目行動。哥譚女沒有聽從蝙蝠女俠的話，她還是到了黑門監獄，並動用了超能力一下子把怪物小兵揍飛了。但哥譚女很明顯有些亢奮了，這時夜翼也到了黑門監獄，他說兩人一起合作。
哥譚女和夜翼被感染
哥譚女大開殺戒消滅了怪物，但手法殘暴，她和夜翼都被怪物的血液感染了，變成了怪物。與此同時，疏散人群的山洞出現了問題，一種感染人的硅藻泥開始改變人們的心智，暴力行為增加， 掠奪者小隊通過發現高溫度燃燒能夠驅散這種硅藻泥。
這時蝙蝠女俠利用通訊頻道問哥譚女和夜翼黑門監獄的事處理的如何，但變成怪物的哥譚女和夜翼根本無法回答她，蝙蝠家族的處境越來越危險。怪物化的哥譚女和夜翼衝向了市區，蝙蝠俠和蝙蝠女俠阻擋他們，蝙蝠俠利用泥麵人的特性覆蓋在自己身上變成泥之裝甲蝙蝠俠與之打鬥。這時，信標出現了，杜克·托馬斯也是一位少年超級英雄，現居住於蝙蝠俠布魯斯·韋恩的家裡，他和阿爾弗雷德在蝙蝠洞分析數據，很多次幫助蝙蝠俠。這次他穿上他的黃色戰服帶來了解藥來到了戰場上。經過一番纏鬥，信標順利的把解藥注入了哥譚女的身體內。這個解藥的原理是把重新編程的新細胞注射進去，重新改寫宿主的內部，清空宿主受感染的身體，哥譚女恢復了原貌。但是蝙蝠女俠還在和怪物化的夜翼大戰，這時蝙蝠女俠受傷，正在墜落……
夜翼通過調查，發現一切始作俑者正是斯特蘭奇教授，他是蝙蝠俠的對手之一。蝙蝠俠決定去會會這個人。與此同時， 那些被驅散的病毒細胞慢慢合成了一個巨大的怪物……
怪物大軍之夜篇”的結局
蝙蝠俠告訴蝙蝠家族，他為了保護哥譚，在哥譚市四周都修建了哥譚瞭望塔，這是一個火力極強的堡壘。他讓蝙蝠女俠、夜翼等人去那裡啟動，利用哥譚瞭望塔阻擋巨大的怪物。另一邊蝙蝠俠找到了斯特蘭奇教授，原來斯特蘭斯教授穿上蝙蝠俠的衣服想替代蝙蝠俠，他知道蝙蝠俠是不可能殺死自己，因為蝙蝠俠有自己的準則。但是蝙蝠俠讓泥麵人把房間外部都包圍起來。整個空間被封閉的密不透風，斯特蘭奇教授因為缺氧昏迷了，就這樣蝙蝠俠不戰而勝。哥譚瞭望塔無法阻擋堅不可摧的怪物，大家都一籌莫展，這時夜翼拿著解毒劑跳到了怪物的血盆大口之中，最終怪物被自動消解掉了，斯特蘭斯教授被蝙蝠俠關到了一個地方，哥譚市恢復了和平。正義聯盟也在幫忙收拾城市的殘骸。哥譚市又恢復了一片平靜。
總體來說，重生時期《蝙蝠俠》第2個故事——怪物大軍之夜篇還算的是精彩，蝙蝠家族的互動，三刊之間的聯動，都讓人印象深刻。其實在這個故事裡，最讓我釋懷的是蝙蝠俠布魯斯·韋恩對紅羅賓提姆·德雷克的死亡耿耿於懷，他不想再失去蝙蝠家族的其他人了（紅羅賓之死詳見《偵探漫畫》第934話-第940話“蝙蝠軍團崛起篇”，但提姆沒有死，提姆只是被奧茲關在了場外監獄裡）。雖然蝙蝠俠很愛他的夥伴和家人，但在守護哥譚的這件事上，他已經隨時做好犧牲自己的準備了。
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