有點腫的神射手
哎呀我的天！看了題主的這個問題，本人就被難住了。這明顯是一個相當專業的生理學問題。
抱歉，本人在大學學的卻是生物學。有所涉及。
所以接下來的所述只是皮毛。
關於小男孩和小女孩長相不一樣。我們可以這樣理解，我們身體是由不同的組織組成，不同的組織由不同的細胞構成，不同的細胞是由不同的基因表達而成。
初始一段時間，小男孩和小女孩不能很明顯地分辨出，是因為他們的身體都還處在生長髮育階段，相貌特徵的基因表達沒有完全。
到了第一性徵出現的時候，也就是男女孩的下面開始變得特徵明顯的時候，此時主導的是遺傳物質——染色體。
眾所周知，男的染色體是XY，女的染色體是XX。到了第二性徵出現時，Y染色體上的基因充分表達，體內性激素開始分泌，讓男孩具有男人具備的所有特徵，包括，喉結，汗毛，體質強壯，肌肉發達等。X染色體的基因表達，讓女孩具備女人所有的特徵，包括，皮膚細膩，乳房發育等。造成了小男孩和小女孩長相就不一樣。
總之，性激素分為雄激素和雌激素兩種，雄激素持續作用於男性，雌激素持續作用於女性。使得兩者在性徵和外貌上顯得不同。
娛情飯桶說
一切最核心的還是基因，男孩和女孩從生物學角度的區別是染色體不同，女孩是X，男孩是Y。面相的遺傳可能來源於母親，也可能是父親，同時也與顯隱性有關。如果控制面相的基因都基本相同，而男孩和女孩長相還是有差異，是因為，男孩和女孩體內分泌激素的量不同，從而影響骨骼，體質等方面，如雄性激素量多更加促進毛髮，骨骼等發育。基因表達是多方面，多層次，基因可以影響酶活，激素，蛋白質等各方面的合成，從而到可見的形狀。另外，激素是生長髮育不可缺少的，因此男孩女孩均需要激素，自身也分泌激素，切都有雄性激素和雌性激素，只是量有差異。
風與影
小女孩和小男孩在青春期之前，長相上沒有什麼區別，真正的區別在於孩子的著裝打扮和髮型。也不會分泌性激素，有人會有疑問，那為什麼小男孩都特別的鬧，小女孩就特別的安靜呢？有兩個原因，一個是孩子的天性，從孃胎裡帶出來的，這個無論男孩女孩，比如說小男孩新歡玩具汽車和槍，而小女孩喜歡布娃娃。還一個關鍵因素就是環境，在孩子成長的環境中，孩子是張白紙，而在他周圍的環境中，家長認為他是個男孩，就會以男孩的思維培養他，就會越來越有男子氣概。
早瞻資訊
小男孩和小女孩長相基本一樣，主要還是看性格，女孩子小時候活潑一點，男孩子反而相比較就安靜一點。
雄性激素是由睪丸合成和分泌的，正常男孩10到13歲就開始進入青春期，進入青春期以後就開始分泌雄性激素，所以童年基本沒有性激素分泌。
風塵濁酒
所有人在最初的胚胎狀態都是女孩。男孩其實是在女孩的基礎上加入了染色體Y之後改裝的。大約在胚胎髮育的第八週，男孩細胞裡面的染色體Y開始活動，睪丸素開始分泌。睪丸素是導致男孩和女孩不同的根本原因。
男性兒童進入青春期後，睪丸開始分泌雄激素，以促進生殖器官的發育，出現第二性徵併產生性慾。一般從10-11歲開始。
女性進入青春期後，卵巢開始分泌雌性激素，以促進陰道、子宮、輸卵管和卵巢本身的發育，同時子宮內膜增生而產生月經。雌性激素可以使皮膚保持水分，促進皮膚新陳代謝及血液循環，使皮膚柔嫩、細緻，還會使乳腺增生，產生乳房、乳暈，並將脂肪選擇性的集中在乳房、大腿 、臀部，以此讓女性的身材優美且有曲線，產生並維持女性的第二性徵。
天漢之子
父親提供的精子有X,Y之分，與母親的卵子X,X結合成為男孩XY或女孩XX。因此在染色體結合的那一刻就決定了孩子的性別，當然從那時候就決定了它以後的性激素分泌情況。所以隨著男孩女孩的生長髮育性別長相動作等差別也就越來越顯著，當然後天的生存環境等影響也是有的。
瞧這蝸牛
所有人在最初的胚胎狀態都是女孩。男孩其實是在女孩的基礎上加入了染色體Y之後改裝的。大約在胚胎髮育的第八週，男孩細胞裡面的染色體Y開始活動，睪丸素開始分泌。睪丸素是導致男孩和女孩不同的根本原因。
十四叔的家常便飯
基因染色體不同 性格不同。小的時候男女長相併沒有太大區別。還有一個主要原因是家長從小給予的性別區分，男孩 女孩 從小從穿著打扮玩具上有了明顯的性別劃分 讓孩子在小的時候逐漸培養了性別意識
