1、 黑白合同問題：中標文件中的專用合同條款，雙方當事人的意思自治不得任意超過《招標投標法》的第46條強制性規定。合法有效的中標合同之外另行簽訂的合同，與中標合同實質性條款和內容不一致的，以中標合同作為價款的結算依據，作為專業分包單位，一定要注意中標合同的實質性內容規定。
2、 工程進度款的支付方式：如果銀行公對公支付方式，建議在合同中約定賬戶基本信息（例如：賬號、開戶行、戶名之類），目的為了保存系列資金流水，以免日後訴訟證據保存。公司是否可以支持多種支付方式，由財務來商定，且注意跟蹤保函承兌支付等方式的期限；注意是否含稅。
3、 委託權限：公司會有分包合同（從合同），例如勞務分包、採購一類。無論作為承包人還是分包人，都應注意附件承包代表人或者項目經理的身份信息，聯繫方式，委託授權權限，建議合同最好一事一委託，避免項目經理或者代表人越權、私刻公章，無權代理等違法行為，加大未來訴訟中追責的難度。
4、 工期延誤和違約金：工期延誤的情形，公司作為承包方乙方，應分辨和規定工期延誤的原因和責任劃分，如不可抗力、甲方原因或者非乙方原因的情形，公司概不負責。發包人一般會規定過高工期延誤的違約金，公司應注意違約金是否為甲方的實際損失，如果甲方不能證明，則應該根據實踐參考，一般違約金不得超過合同價款的10%；
若發包人違約支付工程款，公司可以同樣條件限制發包方拖欠工程款的違約責任。
5、 質保金：一般甲方規定的質保金額較高，根據《建設工程質量保證金管理辦法》的規定，一般質保金為合同總額的3%。
履約保證金：一般承包人提供履約保證金的，應該發包方提供對等的擔保或者預付款，且履約保證金的返還應該在竣工、結算後的10日內。
6、 其他材料款：施工中的鋼構、鋁板、特殊材料等，是否包含在合同總價中。
7、 與土建總包方之間的責任劃分：作為專業分包單位，應該向總包單位負責，只能對自己施工和控制的範圍內承擔責任，無法代替土建方作為總承包管理的職能，與土建方的協調應該由發包方甲方進行協調。
8、 合同解除的情形和價款支付：若甲方施工途中非因乙方原因終止或者解除合同，施工價款正常結算，且支付違約金。
9、 爭議解決：若協調不成，建議所在地的人民法院訴訟解決。
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