中藥發酵用活菌來轉化中藥，在提高中藥療效的同時，還含有益生菌及各種代謝酶、次級謝產物等，和中藥中的有效成分共同作用，能夠迅速調整腸道微生態平衡，提高機體對所營養物質和中藥有效成分的吸收利用效率，從而達到提高生產性能和機體免疫力的效果最。經優化的乳酸菌中藥發酵製劑可提高感染球蟲雞的生長性能，且能增強機體免疫水平。
預防大腸桿菌病，中藥經微生物發酵後，成分發生變化，可提高中藥的療效，增強中藥對病原菌的抑制作用。保肝護肝，活菌中藥發酵對提高機體抗氧化能力具有一定的作用，能夠治療肉雞肝損傷。抗病毒，防治病毒性疾病方面可取得更好的效果。其他應用，中藥發酵對家禽臨床的壞死性腸炎、腸毒綜合徵、腎病綜合徵、肌腺胃炎療效顯著。對雞肌腺胃炎療效確切，用藥2日即可明顯提高採食量，4日基本恢復正常採食量，臨床症狀顯著改善。
營養作用：中藥發酵中的主要有效活性成分———多糖、苷類、生物鹼、葡萄糖氧化酶、過氧化氫酶、揮發油類有機酸類等，它們起著調節動物機體免疫功能的作用。多糖是免疫活動的主要物質，促進胸腺反應，刺激巨噬細胞吞噬的功能;苷類可加強網狀內皮系統吞噬功能，並能促使抗體生成，促進抗原抗體反應和淋巴細胞轉化;有機酸能調節胃腸內的pH值，防止有害細菌的繁殖和提高酶的活性，促進動物體內常的新陳代謝，從而提高營養物質的利用率，促進了動物生產性能的發育。
免疫作用：中藥發酵中的多糖類、有機酸類、生物鹼類、苷類、揮發油類等有增強免疫作用，中藥發酵免疫增效劑能顯著提高動物機體單核細胞、嗜酸性粒細胞的活性，提高白細胞的吞噬能力。清熱解毒，殺菌抗菌、中藥發酵具有抗炎、抗病毒、免疫抑制，阻斷肝細胞凋亡，穩定細胞膜，激活細胞等功能。
激素樣作用：中藥發酵本身不是激素，但可以起到激素相似的作用，並能減輕或防止、消除外激素的毒副作用，所以被認為是勝似激素的激素樣作用物，中藥發酵能不同程度地抑制NA誘導的細胞外Ca2+內流產生的血管平滑肌的收縮，能夠顯著地抑制NA誘導的細胞內“鈣庫”Ca2+中釋放。
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