圖數據庫 Nebula Graph TTL 特性


圖數據庫 Nebula Graph TTL 特性

導讀

身處在現在這個大數據時代,我們處理的數據量需以 TB、PB, 甚至 EB 來計算,怎麼處理龐大的數據集是從事數據庫領域人員的共同問題。解決這個問題的核心在於,數據庫中存儲的數據是否都是有效的、有用的數據,因此如何提高數據中有效數據的利用率、將無效的過期數據清洗掉,便成了數據庫領域的一個熱點話題。在本文中我們將著重講述如何在數據庫中處理過期數據這一問題。

在數據庫中清洗過期數據的方式多種多樣,比如存儲過程、事件等等。在這裡筆者舉個例子來簡要說明 DBA 經常使用的存儲過程 + 事件來清理過期數據的過程。

存儲過程 + 事件清洗數據

存儲過程(procedure)

存儲過程是由一條或多條 SQL 語句組成的集合,當對數據庫進行一系列的讀寫操作時,存儲過程可將這些複雜的操作封裝成一個代碼塊以便重複使用,大大減少了數據庫開發人員的工作量。通常存儲過程編譯一次,可以執行多次,因此也大大的提高了效率。

存儲過程有以下優點:

  • 簡化操作,將重複性很高的一些操作,封裝到一個存儲過程中,簡化了對這些 SQL 的調用
  • 批量處理,SQL + 循環,減少流量,也就是 “跑批”
  • 統一接口,確保數據的安全
  • 一次編譯多次執行,提高了效率。

以 MySQL 為例,假如要刪除數據的表結構如下:

<code>mysql> SHOW CREATE TABLE person;
+--------+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
| Table | Create Table |
+--------+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
| person | CREATE TABLE `person` (
`age` int(11) DEFAULT NULL,
`inserttime` datetime DEFAULT NULL
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8 |
+--------+---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
1 row in set (0.00 sec)
/<code>

創建一個名為 person 的表,其中 inserttime 字段為 datetime 類型,我們用

inserttime 字段存儲數據的生成時間。

創建一個刪除指定表數據的存儲過程,如下:

<code>mysql> delimiter //

mysql> CREATE PROCEDURE del_data(IN `date_inter` int)
-> BEGIN
-> DELETE FROM person WHERE inserttime < date_sub(curdate(), interval date_inter day);
-> END //

mysql> delimiter ;
/<code>

創建一個名為 del_data 的存儲過程,參數 date_inter 指定要刪除的數據距離當前時間的天數。當表 person 的 inserttime 字段值(datetime 類型)加上參數 date_inter 天小於當前時間,則認為數據過期,將過期的數據刪除。

事件(event)

事件是在相應的時刻調用的過程式數據庫對象。一個事件可調用一次,也可週期性的啟動,它由一個特定的線程來管理,也就是所謂的 “事件調度器”。事件和觸發器類似,都是在某些事情發生的時候啟動。當數據庫上啟動一條語句的時候,觸發器就啟動了,而事件是根據調度事件來啟動的。由於它們彼此相似,所以事件也稱為臨時性觸發器。事件調度器可以精確到每秒鐘執行一個任務。

如下創建一個事件,週期性的在某個時刻調用存儲過程,來進行清理數據。

<code>mysql> CREATE EVENT del_event  
-> ON SCHEDULE
-> EVERY 1 DAY
-> STARTS '2020-03-20 12:00:00'
-> ON COMPLETION PRESERVE ENABLE
-> DO CALL del_data(1);
/<code>

創建一個名為 del_event 的事件,該事件從 2020-03-20 開始,每天的 12:00:00 執行存儲過程 del_data(1)。

然後執行:

<code>mysql> SET global event_scheduler = 1;
/<code>

打開事件。這樣事件 del_event 就會在指定的時間自動在後臺執行。通過上述的存儲過程 del_data 和事件 del_event,來達到定時自動刪除過期數據的目的。

TTL(Time To Live) 清洗數據

通過上述存儲過程和事件的組合可以定時清理數據庫中的過期數據。圖數據庫 Nebula Graph 提供了更加簡單高效的方式--使用 TTL 的方式來自動清洗過期數據

使用 TTL 方式自動清洗過期數據的好處如下:

  1. 簡單方便
  2. 通過數據庫系統內部邏輯進行處理,安全可靠
  3. 數據庫會根據自身的狀態自動判斷是否需要處理,如果需要處理,將在後臺自動進行處理,無需人工干預。

TTL 簡介

TTL,全稱 Time To Live,用來指定數據的生命週期,數據時效到期後這條數據會被自動刪除。在圖數據庫 Nebula Graph 中,我們實現 TTL 功能,用戶設置好數據的存活時間後,在預定時間內系統會自動從數據庫中刪除過期的點或者邊。

在 TTL 中,過期數據會在下次 compaction 時被刪除,在下次 compaction 之前,query 會過濾掉過期的點和邊。

圖數據庫 Nebula Graph 的 TTL 功能需 ttl_col 和 ttl_duration 兩個字段一起使用,到期閾值是 ttl_col 指定的屬性對應的值加上 ttl_duration 設置的秒數。其中 ttl_col 指定的字段的類型應為 integer 或 timestamp,ttl_duration 的計量單位為秒。

TTL 讀過濾

針對 tag / edge,Nebula Graph 在 TTL 中將讀數據過濾邏輯下推到 storage 層進行處理。在 storage 層,首先獲取該 tag / edge 的 TTL 信息,然後依次遍歷每個頂點或邊,取出 ttl_col 字段值,根據 ttl_duration 的值加上 ttl_col 列字段值,跟當前時間的時間戳進行比較,判斷數據是否過期,過期的數據將被忽略。

TTL compaction

RocksDB 文件組織方式

圖數據庫 Nebula Graph 底層存儲使用的是 RocksDB,RocksDB 在磁盤上的文件是分為多層的,默認是 7 層,如下圖所示:

圖數據庫 Nebula Graph TTL 特性

SST 文件在磁盤上的組織方式

Level 0 層包含的文件,是由內存中的 Memtable flush 到磁盤,生成的 SST 文件,單個文件內部按 key 有序排列,文件之間無序。其它 Level 上的多個文件之間都是按照 key 有序排列,並且文件內也有序,如下圖所示:


圖數據庫 Nebula Graph TTL 特性

非 Level 0 層的文件數據劃分

RocksDB compaction 原理

RocksDB 是基於 LSM 實現,但 LSM 並不是一個具體的數據結構,而是一種數據結構的概念和設計思想,具體細節參考LSM 論文。而 LSM 中最重要部分就是 compaction,由於數據文件採用 Append only 方式寫入,而對於過期的數據,重複的、已刪除的數據,需要通過 compaction 進行逐步的清理。

RocksDB compaction 邏輯

我們採用的 RocksDB 的 compaction 策略為 Level compaction。當數據寫到 RocksDB 時,會先將數據寫入到一個 Memtable 中,當一個 Memtable 寫滿之後,就會變成 Immutable 的 Memtable。RocksDB 在後臺通過一個 flush 線程將這個 Memtable flush 到磁盤,生成一個 Sorted String Table (SST) 文件,放在 Level 0 層。當 Level 0 層的 SST 文件個數超過閾值之後,就會與 Level 1 層進行 compaction。通常必須將 Level 0 的所有文件 compaction 到 Level 1 中,因為 Level 0 的文件的 key 是有交疊的。

Level 0 與 Level 1 的 compaction 如下:


圖數據庫 Nebula Graph TTL 特性

Level 0 與 Level 1 的 compaction

其他 Level 的 compaction 規則一樣,以 Level 1 與 Level 2 的 compaction 為例進行說明,如下所示:


圖數據庫 Nebula Graph TTL 特性

Level 1 與 Level 2 的 compaction

當 Level 0 compaction 完成後,Level 1 的文件總大小或者文件數量可能會超過閾值,觸發 Level 1 與 Level 2 的 compaction。從 Level 1 層至少選擇一個文件 compaction 到 Level 2 的 key 重疊的文件中。compaction 後可能會觸發下一個 Level 的 compaction,以此類推。

如果沒有 compaction,寫入是非常快的,但這樣會造成讀性能降低,同樣也會造成很嚴重的空間放大問題。為了平衡寫入、讀取、空間三者的關係,RocksDB 會在後臺執行 compaction,將不同 Level 的 SST 進行合併。

TTL compaction 原理

除了上述默認的 compaction 操作外(sst 文件合併),RocksDB 還提供了 CompactionFilter 功能,可以讓用戶自定義個性化的 compaction 邏輯。Nebula Graph 使用了這個 CompactionFilter 來定製本文討論的 TTL 功能。該功能是 RocksDB 在 compaction 過程中,每讀取一條數據時,都會調用一個定製的 Filter 函數。TTL compaction 的實現方法就是在 Filter 函數中實現 TTL 過期數據刪除邏輯,具體如下:

  1. 首先獲取 tag / edge 的 TTL 信息
  2. 然後遍歷每個頂點或邊數據,取出 ttl_col 列字段值
  3. 根據 ttl_duration 的值加上 ttl_col 列字段值,跟當前時間的時間戳進行比較,然後判斷數據是否過期,過期的數據將被刪除。

TTL 用法

在圖數據庫 Nebula Graph 中,edge 和 tag 實現邏輯一致,在這裡僅以 tag 為例,來介紹 Nebula Graph 中 TTL 用法。

創建 TTL 屬性

Nebula Graph 中使用 TTL 屬性分為兩種方式:

create tag 時指定 ttl_duration 來表示數據的持續時間,單位為秒。ttl_col 指定哪一列作為 TTL 列。語法如下:

<code>nebula> CREATE TAG t (id int, ts timestamp ) ttl_duration=3600, ttl_col="ts"; 

/<code>

當某一條記錄的 ttl_col 列字段值加上 ttl_duration 的值小於當前時間的時間戳,則該條記錄過期,否則該記錄不過期。

  • ttl_duration 的值為非正數時,則點的此 tag 屬性不會過期
  • ttl_col 只能指定類型為 int 或者 timestamp 的列名。

或者 create tag 時沒有指定 TTL 屬性,後續想使用 TTL 功能,可以使用 alter tag 來設置 TTL 屬性。語法如下:

<code>nebula> CREATE TAG t (id int, ts timestamp );
nebula> ALTER TAG t ttl_duration=3600, ttl_col="ts";
/<code>

查看 TTL 屬性

創建完 tag 可以使用以下語句查看 tag 的 TTL 屬性:

<code>nebula> SHOW CREATE TAG t;
=====================================
| Tag | Create Tag |
=====================================
| t | CREATE TAG t (
id int,
ts timestamp
) ttl_duration = 3600, ttl_col = id |
-------------------------------------
/<code>

修改 TTL 屬性

可以使用 alter tag 語句修改 TTL 的屬性:

<code>nebula> ALTER TAG t ttl_duration=100, ttl_col="id"; 

/<code>

刪除 TTL 屬性

當不想使用 TTL 屬性時,可以刪除 TTL 屬性:

可以設置 ttl_col 字段為空,或刪除配置的 ttl_col 字段,或者設置 ttl_duration 為 0 或者 -1。

<code>nebula> ALTER TAG t1 ttl_col = ""; -- drop ttl attribute
/<code>

刪除配置的 ttl_col 字段:

<code>nebula> ALTER TAG t1 DROP (a); -- drop ttl_col
/<code>

設置 ttl_duration 為 0 或者 -1:

<code>nebula> ALTER TAG t1 ttl_duration = 0; -- keep the ttl but the data never expires
/<code>

舉例

下面的例子說明,當使用 TTL 功能,並且數據過期後,查詢該 tag 的數據時,過期的數據被忽略。

<code>nebula> CREATE TAG t(id int) ttl_duration=100, ttl_col="id";
nebula> INSERT VERTEX t(id) values 102:(1584441231);

nebula> FETCH prop on t 102;
Execution succeeded (Time spent: 5.945/7.492 ms)
/<code>

注意:

  1. 當某一列作為 ttl_col 值的時候,不允許 change 該列。 必須先移除 TTL 屬性,再 change 該列。
  2. 對同一 tag,index 和 TTL 功能不能同時使用。即使 index 和 TTL 創建於不同列,也不可以同時使用。

edge 同 tag 的邏輯一樣,這裡就不在詳述了。

TTL 的介紹就到此為止了,如果你對圖數據庫 Nebula Graph 的 TTL 有改進想法或其他要求,歡迎去 GitHub:https://github.com/vesoft-inc/nebula issue 區向我們提 issue 或者前往官方論壇:https://discuss.nebula-graph.io/ 的 Feedback 分類下提建議

作者有話說:Hi,我是 panda sheep,是圖數據庫 Nebula Graph 研發工程師,對數據庫領域非常感興趣,也有自己的一點點心得,希望寫的經驗分享能給大家帶來幫助,如有不當之處也希望能幫忙糾正,謝謝~


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