一、組成單元不同
氨基酸：氨基酸由含羧基和氨基的碳鏈組成的化合物。
核苷酸：核苷酸是由嘌呤鹼或嘧啶鹼、核糖或脫氧核糖以及磷酸三種物質組成的化合物。
二、所含元素不同
氨基酸：氨基酸不一定含有磷元素。
核苷酸：核苷酸由於組成中包含磷酸，所以含有磷元素。
三、形成的大分子不同
氨基酸：以氨基酸為單體形成的大分子是蛋白質。
核苷酸：以核苷酸為單體形成的大分子是核酸。
四、用途不同
氨基酸：氨基酸用於合成組織蛋白質，轉變為碳水化合物和脂肪。
核苷酸：核苷酸參與生物的遺傳、發育、生長等基本生命活動。
一個是蛋白質的基本組成單位；一個是核酸的基本組成單位。如果非要找二者之間的聯繫，那就是氨基酸脫水縮合形成蛋白質，而核酸能控制蛋白質的合成。
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