RO膜反滲透系統的故障通常至少出現下列情況：
第一、在工作壓力，電導率正常時，產水量下降；
第二、標準化後脫鹽率降低，在反滲透系統中表現為產水電導率升高；
第三、標準化後產水量下降，通常需要提高運行壓力來維持額定的產水量即工作壓力上升。
1、標準化後產水量下降
RO系統出現標準化後產水量降低，可根據下述三種情況尋找原因：
（1）RO系統的第一段產水量降低，則存在顆粒類汙染物的沉積；
（2） RO系統的最後一段產水量降低，則存在結垢汙染；
（3）RO系統的所有段的產水量都降低，則存在汙堵；
2、標準化後產水量下降是最常見的系統故障之一，其可能的原因是：
（1）膜組件的減少即要按照設計的膜組件數量運行；
（2）反滲透膜低壓運轉即在設計的基準壓力以下運行（可能有節流閥）；
（3）發現膜組件壓密即當反滲透膜在大大超過基準壓力的條件下運轉就會發生膜組件的壓密，必須更換膜組件；
（4）運轉溫度的降低，按照設計溫度25度運行；
（5）在較高的回收率條件下運轉，這會增加平均進水\\濃水的TDS，從而增加滲透壓.當在75%以上回收率條件下運轉時，濃水的水量就減少，這樣膜組件內水的濃縮倍率上升，結果造成給水水質嚴重下降，由於這種給水的滲透壓上升，導致透水量的減少，嚴重時，將膜面析出鹽垢，必須按設計回收率產水；
（6）膜發生汙染。金屬氧化物或汙濁物附在膜面上而造成反滲透膜的堵塞（最主要的）。
（7）在運轉中反滲透的壓差上升，改進預處理的運行管理，改善反滲透的水質，用藥品清洗反滲透組件；
（8）油分的混入，注意油絕對不能進入給水，油會汙染反滲透膜；
（9）保證過濾器內濾芯是否定期更換，長時間不更換，會導致濾芯堵塞，從而影響反滲透的進水量；
（10）進水電導率的增加，這會增加產水通過膜時所必須克服的滲透壓；
3、電導率上升解決辦法（1）首先要確認各閥門開啟是否正確，純水與濃水的比例是否正確；
（2）進水電導率是不是升高即進水電導率是不是比以前升高（如虎門鹹潮時，電導率上升到1000μs\\cm）；
（3）反滲透膜是否受到汙染如無機物結垢CaSO4，MgSO4，BaSO4，有機物汙染，金屬氧化物的汙染等；
（4）反滲透膜是否與強氧化劑(如Cl2)等接觸，被強氧化劑降解.任何氧化物質的接觸都會損壞膜元件；
（5）O型圈損壞或洩漏，O型圈洩漏會導致反滲透出水電導率上升很快；
（6）反滲透膜接觸強氧化性的物質如Cl2，O3等，被強氧化性的物質氧化降解。
4、產水量下降的原因及解決辦法
（1）RO反滲透膜是否受到汙染或被堵；
（2）進水電導率上升；
（3）發現膜組件壓密即當反滲透膜在大大超過基準壓力的條件下運轉就會發生膜組件的壓密，必須更換膜組件。
（4）工作壓力是否達到反滲透膜額定工作壓力。根據反滲透膜的型號確定額定工作壓力，適當提高進水壓力，可以增加產水量。
（5）原水中含有一定濃度的懸浮物和溶解性物質。
懸浮物主要是無機鹽、膠體和微生物、藻類等生物性顆粒。溶解性物質主要是易溶鹽和難溶鹽、金屬氧化物、酸鹼等。在反滲透過程中，進水的體積在減少，懸浮顆粒和溶解性物質的濃度在增加。懸浮顆粒會沉積在膜上，堵塞水流道、增加摩擦阻力（壓力降）。難溶鹽在超過其飽和極限時，會從濃水中沉澱出來，在膜面上形成結垢，降低RO膜的通量，增加運行壓力和壓力降，並導致產品水質下降。
（6）水溫的影響。
反滲透膜額定產水量是基於25℃設計的，溫度每降低1℃，產水量下降2-3%。
以上種種因素都使反滲透膜的產水量逐步下降，透鹽率逐步上升，純水質量下降。一般情況下，反滲透膜的使用壽命是2~3年。反滲透膜損壞後應及時更換，否則不但影響產水量，而且水質變差。
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