通過了招飛體檢的初檢和複檢，以後經歷的體檢就是年度體檢了，相比招飛體檢而言，有很多檢查都是省略的，並不常規進行，這些檢查都是什麼呢？
一、物理檢查
1、外科檢查
年度體檢不再要求男生裸體，女生著內衣了，僅僅要求暴露雙前臂、頸部和雙小腿，男性可能要看一下腹部和背部有無手術疤痕，根據主訴檢查肛門情況。同時，踢腿功能、縱跳雙足跟踢打臀部等動作也省略了，腋臭檢查、睪丸觸診等也省略了。腿長也不再測量了。
2、內科檢查
內科檢查在病史詢問上相對簡單了，其他檢查沒有太多變化。
3、眼科檢查
對於裸眼視力不良的不再檢查裸眼遠視力了，僅檢查矯正視力。不再常規隱斜檢查和裂隙燈檢查；看眼底也不常規散瞳。
4、耳鼻喉科檢查
不常規進行嗅覺檢查。
二、輔助檢查
不常規進行乙型肝炎表面抗原和腦電圖（睜閉眼、過度換氣）檢查。
綜上，年度體檢相比招飛體檢而言，簡化最大的是外科和眼科，尤其是眼科，很多同學非常擔心的裸眼視力、隱斜、裂隙燈和散瞳眼底檢查都大大省略了。
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