医疗事故鉴定与司法鉴定虽然都属于鉴定，但两者无论是法律依据、鉴定组织、鉴定范围、鉴定标准、还是鉴定角度都存在区别，本人认为主要区别如下：
医务人员
1、鉴定的法律依据、鉴定范围不同。
医疗事故鉴定的法律依据是《医疗事故处理条例》，医疗事故鉴定是指国务院和有关医疗主管机构为了科学划分医疗事故等级，正确处理医疗事故争议，保护患者和医疗机构及其医务人员的合法权益，所进行的有关医疗方面的鉴定。
司法鉴定
司法鉴定的法律依据是《全国人大常委会关于司法鉴定管理问题的决定》，司法鉴定是指在诉讼活动中鉴定人运用科学技术或者专门知识对诉讼涉及的专门性问题进行鉴别和判断并提供鉴定意见的活动。司法鉴定一般包括法医类鉴定、物证类鉴定、声像资料鉴定等。法医类鉴定包括法医病理鉴定、法医临床鉴定、法医精神病鉴定、法医物证鉴定和法医毒物鉴定。物证类鉴定，包括文书鉴定、痕迹鉴定和微量鉴定。声像资料鉴定，包括对录音带、录像带、磁盘、光盘、图片等载体上记录的声音、图像信息的真实性、完整性及其所反映的情况过程进行的鉴定和对记录的声音、图像中的语言、人体、物体作出种类或者同一认定。
医疗事故鉴定主要是对人身损害进行的鉴定，而司法鉴定包括人身损害鉴定和人身损害之外的鉴定，如文书鉴定、痕迹鉴定和微量鉴定等。
司法鉴定所
2、鉴定组织不同
首次医疗事故技术鉴定只能委托设区的市级医学会，再次鉴定只能委托所属省的省级医学会；必要时，中华医学会可以组织疑难、复杂并在全国有重大影响的医疗事故争议的技术鉴定工作。医疗事故技术鉴定具有明显的地域性及层级性。而医疗过错司法鉴定不受地域范围的限制，各鉴定机构之间也没有隶属关系。
3、人身损害鉴定标准不同。
医疗事故鉴定的标准是为《医疗事故分级标准（试行）》。司法鉴定的标准为最高人民法院、最高人民检察院、公安部、国家安全部、司法部联合发布《人体损伤致残程度分级》。医疗事故鉴定与司法鉴定两者定残的标准不一样。
4、两者鉴定的角度不同。
医疗事故鉴定的角度主要是从医疗技术的角度进行鉴定，依据是《医疗事故技术鉴定暂行办法》，医疗事故鉴定主要是从技术层面进行分析。而司法鉴定的角度，是分析行为与损害后果之间是否存在因果关系，行为人是否有过错。技术分析与过错分析是不相同的，有些案件，从技术上看没有问题，但存在过错，有过错就要承担责任。
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