清朝規例，親王不得入值軍機處。這條規矩從軍機處設立後就被嚴格執行，即便偶爾有親王被調入軍機處，也會很快被調出，不會長期留任，避免打破這個規矩。直到晚清時，
奕訢率先打破親王不得入軍機處的規例，以恭親王身份擔任軍機大臣，參與中樞朝政。奕訢能夠位列中樞絕非偶然，道光以後，清朝國勢日衰，內外交困，急需有才之人。
在道光的皇子中，奕訢是少數比較能幹的人。某種意義上來說，他的能力超過親兄弟咸豐。這是奕訢因此得到重用，也因此遭到排擠。咸豐去世後，奕訢與兩宮太后等人聯手，一起扳倒了八大顧命大臣。
當時兩宮太后對政事都不熟悉，她們頒佈的詔令，很多都是軍機處奕訢的意見。時間一長，就容易產生矛盾。尤其是慈安去世後，慈禧獨攬大權，將奕訢及其班底一同趕出軍機處。
其實，奕訢倒臺後，奕譞被慈禧扶持到檯面。奕譞對奕訢主政時的許多策略，一直比較不滿，認為他在軍事上沒有準備，外交上過於軟弱，對西洋器物較為保守。
奕譞當時已經加封為醇親王，他同樣以親王身份參與朝政。不過，跟奕訢不同，奕譞並沒有直接入軍機處擔任要職。奕譞是光緒親生父親，這麼做是為了避嫌。但是，慈禧下令軍機處，遇到事情要跟醇親王商議。也就是讓醇親王實際領導軍機處辦事。
奕譞又總理海軍衙門事務，可節制全國海軍。當然，實權主要還是掌握在李鴻章手裡，畢竟北洋由李鴻章手創，它又是清朝海軍中勢力最大的力量。其餘海軍，也主要掌握在各地督撫手中。
晚清時，設立了不少新機構。這些新機構一定程度上會分走軍機處的權力。咸豐年間，奕訢在軍機處的中樞以外，設立的總理各國衙門，他自己擔任總理各國事務衙門王大臣職位，掌管外交事務。
奕訢掌權時，在外交事務上也比奕譞後來更有發言權，也更受各國公使尊重和承認。實際上，當年奕訢準備扳倒八大顧命大臣時，就提前聯繫各國公使，爭取他們支持。
奕訢掌握中樞權力的時候，還把內務府大臣跟宗人府總令的職位拿到手中，把權力滲透到宗室和宮廷中。這都是奕譞所沒有的權力。對慈禧而言，她也不可能授予奕譞太多權力，讓他有機會跟自己叫板。
奕譞並未完全無權。相比奕訢推行洋務的作風，奕譞在很長一段時間內，並不被受人重視。這跟他的做人和觀念有關。在扳倒奕訢以前，奕譞對於洋務派所推行的事務頗為不屑，他曾對慈禧上奏：“請撅除一切奇技淫巧，洋人器用。”
但是，在真正主持中樞事務後，奕譞一改過去作風，對海軍、鐵路、電報極為重視。奕譞曾召集軍機大臣，到地方上進行實際考察，商討修建鐵路的方案。
這跟朝堂民間幾乎異口同聲的反對截然不同。為了獲得慈禧支持，奕譞等人還在皇宮裡修建了一條1510米長的鐵路，向大家展示鐵路的好處。
清朝當時修建的唐胥鐵路、津通路、津沽路、盧漢鐵路，背後都有奕譞的功勞，他向戶部爭取到每年200萬兩的固定經費，用來作為修建鐵路的固定經費。當然，他的外交政策跟奕訢並沒有更為強硬，反而軟弱許多。國勢如此，強硬不起來。
奕譞的這種改變，也許就是屁股決定腦袋的最好例子。除了宗人府、內務府、外交上，奕訢權力更多一些。其餘兩人都是入主中樞，處理軍政事務。
如果以地位而言，奕訢地位會比奕譞稍低。他雖然曾有議政王大臣的身份，但是，奕譞畢竟是光緒的親生父親，曾經代替光緒、慈禧巡閱北洋水師。這種身份也是一般親王無法具備的。
不過，跟奕譞相比，奕訢有自己的班底人馬。二次鴉片戰爭後，奕訢拉攏了文祥、桂良、寶鋆、勝保等人，形成一個自己的小集團。奕譞掌權後，雖然也拉攏左宗棠、李鴻章等人，可是，這些人只能算是私交不錯，卻不屬於奕譞的私人團體。
事實上，因為身份關係，奕譞一直不敢形成自己的勢力，跟慈禧叫板，這會影響親兒子光緒的地位。奕譞辦事，一向極為謹慎小心，對慈禧也不敢直接頂撞。所以，即便同樣入主中樞處理事務。兩人之間，仍有區別。
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