1月26日，福田區召開新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控工作指揮部第三次會議暨疫情防控每日調度會，會上衛健、應急等相關部門及十個街道詳細彙報了有關疫情排查、物資保障等情況。目前，全區的疫情防控工作有序推進，情況平穩。
為做好新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控工作，福田區第一時間成立了新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控工作指揮部及各專項工作組，實行“一日一調度、一日一研判、一日一報告、一日一督導”，並啟動重大突發公共衛生事件I級響應。
福田區疾病預防控制中心全體員工24小時備班備戰，不斷優化處置流程，最大程度壓縮調查前期準備時間，以最快速度到達上報疫情的醫療機構，第一時間完成流行病學調查。截至目前福田區醫療機構上報的新型冠狀病毒感染病例全部以最快速度完成流行病學調查，並送至深圳市第三人民醫院隔離治療。據悉，福田區已落實廣中醫深圳醫院和中大八院為轄區醫學觀察點，為下一階段防控工作做準備。增設中大八院為專門應對疫情發生地來深（返深）患者血液透析門診，並將其他患者分流到轄區其他醫院進行診治。
針對即將到來的返深客流，福田區已在交通道路、交通樞紐、社區設立聯合檢疫口，建立部門聯繫機制，抽調人員負責返深、返工、返校人員的健康排查，加強病例監測管理工作。轄區福田汽車站、皇崗汽車站、福田高鐵站及皇崗、福田口岸均已配置了紅外體測溫儀，開展體溫篩查工作，並設置隔離區。26日，福田汽車客運站、皇崗汽車客運站、福田高鐵站共排查入境旅客3149人，沒有發現發熱患者。
在市場供應及消殺方面，福田區動員組織專門力量，啟動轄區肉菜市場專項消殺行動，在晚上市場休市後進行消毒工作。加強活禽和野味市場監督。加強醫藥物資市場監督。對轄區醫療器械經營藥店進行檢查，加強對防疫和所需口罩、抗病毒藥物等物資價格波動情況檢查，抗病毒藥物基本能持續供應，上述物資售賣的經營者價格合理，未發現有價格異常。
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