用糞便治病聽上去可能覺得好笑，但早1700年前東晉時期葛洪編著的《肘後備急方》以及明朝時期李時珍的《本草綱目》中就有提到利用黃龍湯治療嚴重腹瀉或食物中毒的內容 ，《肘後備急方》裡就有“飲糞汁一升，即活”的記載。在日前召開的中國腸道大會上糞便移植治療疾病以其奇特的方式和神奇的效果成為人們關注的熱點。所以說用糞便治病是千真萬確的。
那麼用糞便怎麼能夠治療疾病呢？大家知道人類的腸道內存在1000種100萬億個細菌，經過漫長的進化，它們與人類達到了一種共生共存狀態，它們就是我們平時所說的腸道菌群。大部分的腸道細菌為絕對厭氧菌，包括擬桿菌屬、雙歧桿菌屬、真桿菌屬、乳桿菌屬、消化鏈球菌屬、普氏菌屬、瘤胃球菌屬等。飲食、環境、基因影響內臟細菌的構成。這些微生物的功能包括複雜碳水化合物的消化、能量存儲、免疫功能和抵禦病原體的入侵等。腸道共生菌群能夠通過一系列的局部作用抑制細菌定植。當腸道菌群平衡因為多種原因遭到破壞，就可引起多種疾病，如艱難梭菌的感染、炎症性腸病、肥胖以及自身免疫性疾病、抑鬱症、自閉症等腸外疾病。正常情況下，人體腸道內的有益細菌會維持一個動態平衡，抑制致病菌的增殖。如果這個平衡遭到嚴重破壞（比如腸道艱難梭菌感染，患者自身的菌群可能會永久失去恢復平衡的能力。此時如果採集健康者的便樣，稀釋後注入患者的結腸，讓注入的大便中的有益細菌掌控局勢，在患者腸道安營紮寨，那麼被破壞的平衡或許會恢復，患者也將痊癒。
糞菌移植治病的現代復甦是在西方，自1958年以來全世界已經有數萬例患者接受了糞菌移植技術，主要用來治療感染性腹瀉、炎症性腸病、便秘等胃腸道病症。在國內近兩年有數十家醫院開展了糞菌移植，保守估計，國內已有近4000多例患者接受糞菌移植治療。
糞菌移植有多種不同的形式，上消化道通過鼻飼管或胃鏡。下消化道通過腸鏡、灌腸等，灌腸是最簡單和更容易接受的方式。結腸鏡的方式因更接近病變部位，較灌腸更有效。
糞菌移植為治療很多疾病提供了新希望。但該領域的先驅者表示，還需要對它們進行更加科學地研究。美國麻省總醫院進行一項臨床試驗，要把身材纖瘦者捐助的糞便急速冷凍後，製成膠囊給肥胖的受試者服用，並從中觀察瘦子體內的腸胃微生物群是否能取代體內原有的微生物群，若是成功的話，未來靠“吃屎”也能夠輕鬆減肥了。
來自國外的研究人員稱，糞便移植在治療嚴重感染的使用越來越成為患者的選擇，但隨著使用的增加以及捐助者篩查範圍的擴大，進行良好的長期試驗及監測也非常必要，目的在於為病人提供最為合理的選擇和建議。
腸道微生物群落在我們機體免疫系統和健康中扮演著重要角色，而將糞便物從一個人移植到另一個人目前被人們越來越多地用於治療嚴重的危及生命的感染性疾病，比如難辨梭狀芽胞桿菌感染的復發等，這種細菌每年會引發成千上萬人死亡。糞菌移植將健康供體液化的糞便引入患者的腸道中，從而使健康的細菌菌群在受體腸道中重新定植，通常患者進行長期的抗生素療法後腸道菌群就會被破壞。
如今糞便移植被越來越多地用作治療人類腸道的特殊感染，而且可以成功治療那些養老院和醫院獲得性的感染性疾病，比如難辨梭菌結腸炎，其是一種感染性的腹瀉疾病，通常需要進行抗生素療法，前期研究結果表明，來自健康個體的糞便移植或許可以有效治療多發性硬化症和克羅恩病。
毫無置疑，糞便可以挽救生命，利用糞便移植可以治療難辨梭菌引發的感染，而且據文獻報道目前其治癒率可以達到95%。很多人把它理解成了“糞便移植”，其實才沒有這麼簡單粗暴呢，真正移植的是從糞便中提取的菌群，所以叫“糞菌移植”。
大家偶爾會因為各種原因有一些輕微的腹瀉，但是有些時候腹瀉也是會嚴重到要進醫院的，嚴重腹瀉的一個可能的原因是由艱難梭菌引起的，艱難梭菌是一種厭氧性的細菌，在無氧的環境下能生長得更好，而人的腸道內恰好是一個相對無氧的環境。而且如果過度服用某些抗生素，艱難梭菌菌群的生長速度會加快，破壞腸道內的菌群平衡，引發炎症。這種炎症發作時會導致嚴重的腹瀉和腹痛，且極容易復發，而現在最為有效的就是“糞菌移植”方法。
目前國內糞菌移植還可用於治療的疾病包括：炎性腸病、腸易激綜合徵、不明原因腹痛、腹瀉、便秘以及非胃腸道疾病如代謝綜合徵（肥胖、2型糖尿病）、慢性疲勞綜合徵、自身免疫性疾病、神經系統疾病及自閉症等。相信隨著技術的不斷成熟和普及，應用糞菌移植治療的疾病會不斷增多，效果會更好。
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