01-02賽季，科比場均25.2分，與鯊魚雙雙殺入年度第一陣容，湖人以58勝24負結束常規賽。在季後賽，湖人也有驚無險的再次殺入總決賽。面對新澤西籃網隊，湖人4-0輕鬆拿下總冠軍，完成了三連冠的王朝霸業。這是NBA第5次出現三連冠，科比在23歲就得到了如此成就，但全世界都知道，主角不是他。
2002年夏天，科比給自己增重了7公斤，苦練了背身單打和遠射。整個賽季，科比場均可以拿下30分，力壓奧尼爾，成為球隊的首席得分手，但強弩之末的湖人並沒有在季後賽走得很遠，西部半決賽中，湖人最終被馬刺隊淘汰，未能完成四連冠。
2003年夏天，湖人算是挺完美的，鯊魚給馬龍打了電話，加里佩頓也來了。雖然他們都老了，但每場依然能夠貢獻20分，他們依然是明星。於是，科比，鯊魚，馬龍，佩頓，讓湖人的前景一下子明朗了起來，他們組成了古往今來罕見的偉大陣容。
但之後發生了一些不愉快的的事情，科比陷入了官司當中。整個賽季，科比幾乎都在法庭和訓練營，賽場之間徘徊。這使得他的訓練時間被分割的支離破碎，但這並不妨礙他的手感。賽季結束，科比雖然場均得分跌倒了24分，但依然入選了第一陣容。這一年，他們雖然順利的進入了總決賽，但卻以1-4敗給了底特律活塞隊，無緣總冠軍，F4的陣容終究沒用成功。接下來，洛杉磯要面臨很多事情了。
2004年，禪師離開了湖人，科比的合同也要到期了。科比高調宣佈自己想要去其他球隊打球，很明顯，科比不想給鯊魚打下手了，而鯊魚的合同還剩一年，到了湖人管理層抉擇的時候了。科比26歲，鯊魚32歲，很簡單，單看年齡就可以作出選擇了。湖人便開始兜售鯊魚，據說，湖人還跑去問庫班：“鯊魚換德克怎麼樣？”庫班答：“門都沒有。”最後，湖人將鯊魚送到了邁阿密，湖人王朝的兩個締造者終於還是分道揚鑣了。
04-05賽季，鯊魚走了，佩頓也離開了。不僅如此，科比和馬龍也因為瓦妮莎起了爭執，後來馬龍也直接選擇了退役，再加上去年發生的事情以及菲爾傑克遜在新書《最後的賽季》中對科比的批評，使得科比陷入了無比黑暗的地步。他無意用嘴回擊這一切，他指望用賽場上的表現來回擊這一切的質疑，但結果並不那麼美妙，湖人隊整個賽季都打的很掙扎，儘管科比每場依然能貢獻27.6分，最後湖人自1993-1994賽季以來第一次未能進入季後賽。
受戰績影響，科比最終也僅僅被排進了最佳陣容第三陣。2004年夏天，科比終於如願以償，湖人成了他自己的球隊，但科比像著了魔一般，他急於向全世界證明自己，證明沒有鯊魚自己，也可以帶好團隊，甚至是奪冠，這導致他的心態發生了巨大變化，因此弄巧成拙，科比在鯊魚走後的第一個賽季就被阻擋在了季後賽大門之外。而鯊魚卻在邁阿密過得風生水起。科比在05年，夏天遭受著漫天的非議，這是他生涯以來度過的最黑暗的休賽期了。
在05-06賽季，禪師和科比放下之前的怨恨，再次走到了一起，而科比的心態也開始迴轉，終於從壓力中解脫了出來，2005年的科比也許是世界上技藝最嫻熟，最頂尖的籃球手了，但依舊孱弱的球隊使得科比不得已一個人來解決問題。
於是，2005年的冬天開始炫人奪目。2005年12月20日，湖人對陣達拉斯小牛隊，科比一人前三節狂砍62分，比小牛全隊的61分還要多。於是，在之後的45分，50分，41分都不那麼耀眼了。一直到2006年1月22日，科比將自己的得分能力，身體天賦完全地展示給世界，在對陣多倫多猛龍的比賽中科比全場狂砍81分，這一晚之後，除了張伯倫的單場100分，所有的得分記錄都被其所顛覆，他站在了籃球世界的最頂端。
科比在整個一月份場均43.4分，單賽季連續3次連續4場40+，單賽季總得分2832分，最後場均得分鎖定在35.4分，榮膺得分王，並且率隊殺進季後賽。季後賽首輪，科比面臨的對手是當賽季MVP史蒂夫納什率領的球鳳奔放而熱烈的菲尼克斯太陽隊。科比在第四場的兩次絕殺，一個打進絕殺，一個殺死比賽，這使得湖人取得了3-1的領先。
那時，科比與湖人的晉級似乎就在眼前，然而鳳凰城並沒有繳械投降，他們上演了驚天大逆轉，在系列賽中連下三成，完成逆轉，4-3淘汰湖人。雖然科比這個賽季完成了大蛻變，他不僅是一個超級得分手，他更能組織球隊，之前的防守也都回來了。
科比開始成為一名真正的領袖，但諷刺的是，遠在邁阿密的鯊魚跟著韋德再次得到了一枚總冠軍戒指，而科比卻倒在了第一輪。
在與奧尼爾賭氣的過程中，似乎科比還是一個失敗者，都知道科比那瘋狂的好勝心，永不磨滅的熱情，以及堅韌不拔的，勇於挑戰的精神就註定他不會滿足於此。他的目標不只是比奧尼爾強，不只是季後賽，他的目標是那象徵著至高無上榮譽的奧布萊恩杯。總有人要贏得，為什麼不是我呢?
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