富田興合苑業主的大事小事39、新型冠狀病毒39：單鹼基多型性，DNA 損傷修復的鑑定
“修復主要分為三個步驟：（1）DNA損傷識別，可以直接（總體修復）或以轉錄耦（ǒu）合的方式（轉錄耦合的修復）進行識別；
（2）損傷的3和5端切除，移除核苷酸片段（24~32nt），留下單鏈的DNA；
（3）DNA 合成，填補這個單鏈的DNA，連接，最終恢復完整的DNA雙鏈…”網友說。
…耦：形聲字。從耒，禺（yù或ǒu）聲。耒（lěi），翻土工具。本義：二人並肩耕地…
…耦合：物理學上指兩個或兩個以上的體系或兩種運動形式間通過相互作用而彼此影響以至聯合起來的現象…
…DNA的3端和5端：見《富田興合苑業主的大事小事27》…
生物化學裡面的那個nt是什麼意思？——網友提問
“nucleotide.核苷酸。即有多少核苷酸，和base pair（bp）一樣的意思，如21nt就是21核苷酸…”網友“一滴雪花舞”說。
…bp：Base Pair（鹼基對）的縮寫…見《富田興合苑業主的大事小事34》…
…鹼基：這裡指組成DNA和RNA的五種鹼基——鳥嘌呤（G），腺嘌呤（A），胞嘧啶（C），胸腺嘧啶（T），尿嘧啶（U）…（…A T G C U：見《富田興合苑業主的大事小事16》…）
…鹼基對：一對相互匹配的鹼基（即A—T， G—C，A—U相互作用）被氫鍵連接起來，稱為鹼基對…
“nt表示核苷酸，bp表示鹼基對…一個鹼基對應該包含兩個鹼基，而一個核苷酸裡面應該只有一個鹼基…”網友“媸（chī）鬽（mèi） ”說。
在分子生物學中，nt和bp單位有什麼區別？——網友提問
nt=nucleotide，即核苷酸數，通常用於描述單鏈，如RNA，primer（引物）等；
bp=base pair，即鹼基對，用於描述雙鏈的，如DNA,雙鏈RNA等。（網友回答）
…引物：見《富田興合苑業主的大事小事25、26》…
“切除修復相關基因的功能缺失性突變可導致嚴重的遺傳疾病，包括著色性幹皮病（xeroderma pigmentosum，XP）、 科克因綜合症（Cockayne syndrome，CS）、毛髮硫營養不良（Trichothiodystrophy，TTD）。哪怕只是因為核苷酸多態性和切除修復基因的未激活導致修復效率減低，也會提高皮膚癌的發生率…”網友接著說。
…多態：多種狀態…
…單核苷酸多態性：主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種，佔所有已知多態性的90%以上。SNP在人類基因組中廣泛存在，平均每300個鹼基對中就有1個，估計其總數可達300萬個甚至更多。SNP由單個鹼基的轉換或顛換所引起，也可由鹼基的插入或缺失所致。SNP既可能在基因序列內，也可能在基因以外的非編碼序列上…
…SNP：英文“single（單一的） nucleotide（核苷酸） polymorphism（多態性）”的縮寫，意為單核苷酸多態性，或單鹼基多型性，也就是人與人之間一個鹼基之間的差異。
基因組序列差異有好幾種，如鹼基插入、缺失、SNP以及微衛星等，SNP僅是其中最常見和最普遍的一種，在臨床上有很重大的意義。
人與人的基因序列中有99.9%以上的序列都是相同的，僅有0.1%不同，即1000個鹼基中有1個不同。
人類基因組有30億對鹼基，按此計算，整個人類基因組中有300萬個鹼基不同。
由於SNP是由個人的遺傳背景決定的，且可以作為臨床具有意義的診斷標誌物（Marker），所以發達國家都投入大量的人力與財力進行SNP的解析，努力建成本國國民的SNP數據庫…
“既然 DNA 損傷修復如此重要，那麼UV照射後，細胞哪些位點發生了 DNA 損傷？哪些位點又進行了損傷修復？…這對於深入闡（chǎn）明細胞對 UV 造成的 DNA 損傷的響應機制至關重要…”網友最後說。
…UV：ultraviolet（紫外線）的縮寫…見《富田興合苑業主的大事小事28》…
… 闡：形聲字。從門，單聲。本義：開，打開…
（…形聲：一種造字法…是說字由“形”和“聲”兩部分合成，形旁和全字的意義有關，聲旁和全字的讀音有關。如由形旁“氵（水）”和聲旁“工、可”分別合成“江、河”…
…形聲字：用形聲造字法造出來的字…）
…闡：講明；表明：～述…
…闡明：把深奧的道理講明白…
《詳解 UV 誘導的 DNA 損傷和修復》論文第3部分：檢測UV造成的DNA損傷的策略
…《詳解 UV 誘導的 DNA 損傷和修復》：見《富田興合苑業主的大事小事36》…
“最初 DNA 修復的證據來自於‘意外的 DNA 合成（unscheduled DNA synthesis）’，這種現象隨後被定義為‘修復型複製’。然而，通過‘意外的 DNA 合成’來測定修復，是一種間接的而且只限於非 S期細胞的方法…”網友說。
…S期：指細胞週期S期…
…細胞週期S期：S期又稱為DNA合成期，是指從DNA合成開始到DNA合成結束的整個時期。DNA合成期是DNA在細胞週期中功能最活躍的時期。在這段時間內，DNA既要完成自己的複製，又要進行轉錄和合成蛋白質的活動…
“至今，絕大多數鑑定DNA 損傷和修復的方法，要麼成批地（大量細胞）在整個基因組研究損傷水平；要麼以高分辨率研究一個特定的位點，但又缺乏整體的認識…”網友接著說，“目前有三種用來檢測光二聚體的常用方法：（1）鑑定損傷位點的酶解；（2）損傷特異性抗體；（3）色譜質譜偶聯法…”
…鑑：仔細看；審察：～別。～定…
…鑑定：辨別並確定事物的真偽、優劣等：～碑帖。～出土文物的年代…
…損傷位點的酶解：光解酶切斷二聚體碳鍵，使二聚體恢復成兩個鹼基…見《富田興合苑業主的大事小事38》…
…鑑定損傷位點的酶解：辨別並確定損傷位點有光解酶…
…特、異、特異、性：見《富田興合苑業主的大事小事29》…
…特異性：區別於其他事物的性質；標準物與對比物之間的明顯區別…
“噬菌體由核酸和蛋白質構成。蛋白質起著保護核酸的作用，並決定噬菌體的外形和表面特徵。其核酸只有一種類型，即DNA或RNA，雙鏈或單鏈，環狀或線狀…
請看下集《富田興合苑業主的大事小事40、新型冠狀病毒40：世上蘊含最豐富噬菌體的地方是海水》”
若不知曉歷史，便看不清未來
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