新型冠狀病毒36:一種化學物質與DNA結合時,DNA會受損

富田興合苑業主的大事小事36、新型冠狀病毒36:一種化學物質與DNA結合時,DNA會受損

胡晉川(復旦大學青年研究員)研究方向:課題組利用生化方法和高通量測序技術研究染色質環境中的DNA損傷與修復,主要包括紫外線和抗癌藥物順鉑(bó)等造成的DNA加合物損傷以及相應的核苷酸切除修復。

…生化方法、高通量測序技術、鉑、順鉑、染色質:見《富田興合苑業主的大事小事33~35》…

…加:兩個或兩個以上的東西或數目合在一起:二~三等於五。功上~功…

…合:結合到一起;湊到一起;共同(跟“分”相對):~辦。同心~力…

…加合物:指的是兩個或多個不同的分子,通過互相加合得到的產物。典型的加合物如三氟化硼(BF3)與氨(H3N)加合形成的H3N→BF3。可以用箭頭或者圓點在分子之間作為表示方法…

…DNA加合物(adducts):是DNA片段與致癌化學物質結合形成的複合物,在科學實驗中通常作為暴露的生物標註物。

DNA加合物是化學毒物經生物系統代謝並活化後的親電活性產物與DNA分子特異位點結合形成的共價結合物。

當一種化學物質與DNA結合時,DNA就會受損,DNA複製和細胞複製等生物過程將無法正常進行。這種結合激活了DNA的修復過程。如果受損的DNA沒有受到有效的修復,就可能導致癌症的發生…(…活性:見《富田興合苑業主的大事小事17》…

…特異:見《富田興合苑業主的大事小事29》…

…共價鍵:見《富田興合苑業主的大事小事6》…)

…核、苷、核苷、酸、核苷酸:見《富田興合苑業主的大事小事25》…

新型冠狀病毒36:一種化學物質與DNA結合時,DNA會受損


胡晉川(復旦大學青年研究員)研究方向2:課題組長鬍晉川在2015年諾貝爾化學獎得主Aziz Sancar教授實驗室做博士後期間,主導開發了Damage-seq和XR (eXcision Repair)-seq方法,分別是目前唯一能以單鹼基分辨率檢測人類基因組上各種DNA加合物損傷位置和核苷酸切除修復發生位置的高通量測序方法。在此基礎上,課題組圍繞DNA複製與轉錄對核苷酸切除修復的影響、DNA損傷修復與染色質狀態變化的相互作用、修復與癌症基因組突變發生的聯繫以及修復與順鉑抗藥性的關係等問題開展研究。

…鹼:在水溶液中電離出的陰離子全部都是OH-(氫氧根)的物質;電子給予體(化學反應中失去電子的一方)…

…基:化合物的分子中所含的一部分原子,被看作是一個單位時就叫基:羥~(—OH)。氨~(—NH2)…見《富田興合苑業主的大事小事4》…

…鹼基:鹼基在化學中本是“鹼性基團”的簡稱。有機物中大部分的鹼性基團都含有N(氮)原子,稱為含氮鹼基。氨基(-NH2)是最簡單的含氮鹼基…

…鹼基對:是一對相互匹配的鹼基(即A—T,G—C,A—U相互作用)被氫鍵連接起來。它常被用來衡量DNA和RNA的長度(儘管RNA是單鏈)…

…單鹼基:單獨的鹼基。通常指A T G C U中其中一個鹼基…

…A[腺嘌(piào)呤(lìng)]、T[胸腺嘧(mì)啶(dìng)]、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶):組成核酸和核苷酸的鹼性基團(鹼基)。見《富田興合苑業主的大事小事16》…

…分辨:辨別:~是非。天下著大雨,連方向也~不清了…

…能以單鹼基分辨率:能辨別單鹼基…

2019-05-11 08:20,網友“表現遺傳學”發了篇名為“詳解 UV 誘導的 DNA 損傷和修復”的論文。

…Uv:ultraviolet的縮寫…

…ultraviolet(英文):n.紫外線…見《富田興合苑業主的大事小事28》…

(…n.:英文noun的縮寫,意思是名詞…)

“在分子生物學研究中…我們經常使用 DNA 損傷模型…其中非常常見的一種手段是 UV。UV 照射後,DNA 損傷形式是怎樣的?DNA 損傷後,細胞又是怎麼修復的呢?如何檢測全基因組的 DNA 損傷和修復事件呢?DNA 損傷修復異常與疾病又有怎樣的聯繫?…”網友說,“本文整理了復旦大學胡晉川研究員2017 年發表的題為The Cartography of UV-induced DNA Damage Formation and DNA Repair(紫外線誘導DNA損傷形成與修復的製圖)的論文… 綜述文章的核心要點,以期對上述問題進行解答…”

新型冠狀病毒36:一種化學物質與DNA結合時,DNA會受損


《詳解 UV 誘導的 DNA 損傷和修復》論文第1部分:UV 誘導的三種損傷

“UV 按照波長可分為三類:UVA(315~400 nm)、UVB(280~315 nm)和UVC(100~280 nm)。其中抵達地球表面的UV中,95% 以上是 UVA,其餘是 UVB,而 UVC 被大氣層阻斷…”網友說,“波長越長,穿透能力越強…UVA 的穿透能力最強;而根據 E=hc/λ(h 為普朗克常量,c 為光速,E為能量,λ為波長),波長越短能量越高…UVC 的能量最高。”

…nm:納米…

…納米:1nm=10-9m(1納米=10的負9次方米)…

…E=hc/λ:能量=(普朗克常量×光速)/波長…

“UV 造成的 DNA 損傷中,最主要為嘧啶二聚體,包括環丁烷(wán)嘧啶二聚體、嘧啶6-4嘧啶酮(tóng)光產物,以及它們相關的杜瓦價鍵異構體(Dewar valence isomers)…”網友接著說。

…嘧、啶、嘧啶:見《富田興合苑業主的大事小事9》…

…二聚體、嘧啶二聚體、環丁烷嘧啶二聚體:見《富田興合苑業主的大事小事23~25》…

…酮:一類有機化合物,其特徵是含有與兩個碳原子相連接的羰(tāng)基,這兩個碳原子通常包含在兩個烴(tīng)基中(如在通式RCOR中)…

新型冠狀病毒36:一種化學物質與DNA結合時,DNA會受損


[…羰基(C=O):見《富田興合苑業主的大事小事4》…

…烴基:烴分子失去一個或幾個氫原子(H)而成的基團,通常用R[英語單詞“radical”(基)的首字母]表示,如烷基、烯基、芳香基等(百度漢語);化學中被用來指只含碳、氫兩種原子的基團,一般指相應的烴失去一個氫原子後剩下的基團,甲基(-CH3)和乙基(-C2H5)為最常見的兩種烴基(百度百科)…]

“光致復活作用:一種需要光的DNA修復機制。例如,紫外線輻射能引起在同一DNA鏈的相鄰胸腺嘧啶鹼基(“鹼性基團”簡稱鹼基;胸腺嘧啶是種鹼基)形成二聚體。在可見光某一波長的作用下,二聚體可被酶裂開。這是DNA最有效的修復過程。

請看下集《富田興合苑業主的大事小事37、人本原理;病毒沒有光復活酶(夏日陽光消滅新型guanzhuang病毒的原理)》”


若不知曉歷史,便看不清未來


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