全額事業單位和差額事業單位兩者都不錯，關鍵是所在單位，想幹什麼工作等等，沒有一定的可比性。
全額撥款事業單位也稱為全供事業單位，也就是全額預算管理的事業單位，是其所需的事業經費全部由預算撥款的一種管理形式。這種管理形式，一般適用於沒有收入或收入不穩定的事業單位;如學校、科研單位、衛生防疫、工商管理等事業單位，即人員費用、公用費用都要由財政提供。採用這種管理形式，有利於對事業單位的收入進行的管理和監督，同時使事業單位的經費得到充分的保證。
差額預算管理的事業單位即對有經常、穩定業務收入的單位，採取核算、收支掛鉤、以收抵支的管理形式。既按定員定額指標核定的單位年度經費預算總額與單位創造的收入之比，支大於收的差額部分由預算補助，收大於支的部分上交財政。也可以說差額是按基數加增長的方式由財政負擔，也就是財政給一部分，剩下的單位要自收自支的。
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