阿拉善右旗隸屬於內蒙古自治區阿拉善盟，位於內蒙古自治區西部，龍首山與合黎山褶皺帶北麓，地理座標介於北緯38°38′－42°02′，東經99°44′－104°38′之間，東接阿拉善左旗、甘肅省民勤縣，南鄰甘肅省金昌市、張掖市，西連額濟納旗，北與蒙古國接壤。國境線長45.25公里。全旗東西長415公里，南北寬375公里，總面積73443平方千米。
阿拉善右旗政府駐巴丹吉林鎮。有蒙古族、漢族、回族、藏族、壯族、土族、滿族、達斡爾族、鄂溫克族、彝族等11個民族。
阿拉善右旗古為禹貢雍之域，春秋時屬秦，秦始皇時置北地郡，漢時屬北地、武威、張掖三郡，晉為前涼、後涼、北涼所據，唐屬河西節度使，宋景德中入於西夏，元隸甘肅行中書省，明永樂初為西部反剌地區，清康熙時和碩特部遷之。清王朝將阿拉善和碩特部按內蒙古49旗之例，編為阿拉善和碩特旗，阿拉善旗由此始建，駐定遠營（今巴彥浩特）。清代直屬理藩院，中華民國時屬蒙藏委員會管轄。
1949年9月，阿拉善旗和平解放，和碩特旗人民政府成立，歸寧夏省管轄。
1954年4月，改名為寧夏省蒙古自治區，同年9月，寧夏省建制撤銷，合併於甘肅省，改稱甘肅省蒙古自治州。
1955年，改稱甘肅省巴彥浩特蒙族自治州。
1956年4月，巴彥淖爾盟成立，下轄阿拉善旗、額濟納旗、磴口縣和巴彥浩特市，歸內蒙古自治區管轄。
1960年8月，中共阿拉善旗西部地區工作委員會成立，籌建阿拉善右旗，由巴彥淖爾盟、阿拉善旗雙重領導。
1961年4月22日，國務院全體會議第110次會議通過《關於設立阿拉善左旗和阿拉善右旗，撤銷阿拉善旗的決定》。同年5月25日，中共阿拉善旗西部地區工作委員會撤消，建立阿拉善右旗，駐呼和達布蘇（今雅布賴鹽場舊址）。
1965年9月，旗址遷至額肯呼都格。
1969年7月，劃歸甘肅省武威地區管轄。
1979年7月，重新劃歸內蒙古自治區。
1979年11月，額肯呼都格鎮成立，旗府所在地地名由此沿用。
1980年4月，阿拉善盟成立，阿拉善右旗歸阿拉善盟管轄。
2006年，阿右旗將原有的9個蘇木鎮調整撤併為5個。
2011年5月24日，阿右旗旗府所在地額肯呼都格鎮被批覆更名為巴丹吉林鎮。
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