江海神醫
上海交通大學醫學院附屬XX醫院，醫院人事任命隸屬於醫學院，為原上海第二醫科大學附屬的醫院，換句話說是“親生兒子”，像醫學院附屬瑞金醫院、醫學院附屬仁濟醫院、醫學院附屬新華醫院、醫學院附屬九院等。 上海交通大學附屬醫院人事關係隸屬於上海申康醫院發展中心，不是交大醫學院的“親生兒子”。
其實上海所有三甲醫院都有自己的辦醫主體：復旦系（中山、華山、兒科、婦產科、腫瘤、五官科醫院）、交大系（瑞金、仁濟、新華、九院、兒中心）、申康系（華東、六院、兒童、十院）、同濟系（同濟口腔、同濟、肺科）、中醫大系（龍華、曙光、岳陽）、軍醫大系（長海、長征、東方肝膽）……
所以，醫學院附屬和附屬，就是親兒子和乾兒子的區別。
同理，復旦的親兒子只有六所：中山、華山、兒科、婦產科、腫瘤、五官科。其他附屬都是山寨的……
fofo2
題主提及的問題其實和2000年左右的綜合性大學和醫科大學的合併有關（成立醫學院或部），如當時的上海交通大學和上海第二醫科大學、中南工業大學和湖南醫科大學、四川大學和華西醫科大學、華中理工大學和同濟醫科大學的合併組建，當然也有合併失敗的不少案例。高校和醫科大學的合併組建都面臨著很大的問題，畢竟每個學校都是幾萬人，在合併的協商過程中，彼此都會有條件和讓步。
上海交通大學在和第二醫科大學協商中進展受限後，選擇上海第一人民醫院和上海第六人民醫院成為附屬醫院，準備組建自己的醫學院（多元化發展，比如北京的...）,在劃分給交大後，隸屬關係未變化，僅在前面冠名“上海交通大學附屬”，如上海交通大學附屬第一人民醫院和第六人民醫院。後續上海市兒童醫院、上海胸科醫院同樣劃給交大作為附屬醫院，冠名上海交通大學附屬兒童醫院和胸科醫院。
在2005年，上海交通大學在和第二醫科大學正式合併後，，原上海第二醫科大學附屬瑞金、仁濟、新華、九院、兒中心、寶鋼（2005年改附屬第三人民醫院，2014年與附屬第九人民醫院合併成為九院北部院區）等醫院因學校合併，將原名稱中的“上海第二醫科大學”改為“上海交通大學醫學院”，即“上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院”等。在合併後，上海市將中福會國際和平婦幼保健院、上海市精神衛生中心以及2013年新合併成立的同仁醫院也都劃給交大作為附屬醫院，同時冠名“上海交通大學醫學院附屬某某醫院”。
其實，在合併中學校更多的是希望保留自己原有的傳統和文化，這就導致名稱的不一致，希望對你有所幫助:(
帥小西De
上海交通大學附屬某某醫院，從行政關係上某某醫院是交通大學直屬機構，上海交通大學醫學院附屬某某醫院，行政關係是醫學院直屬機構。
