這次改革以前，新三板只分為創新層和基礎層，2層市場結構下，企業所在的層級“非此即彼”。“精選層-創新層-基礎層”的三層市場架構形成以後，企業層級調整的複雜性凸顯，不同層級如何進入，高層級怎麼退出，需要“排列組合”，掛牌公司可以新三板內部“轉層”，符合條件的精選層企業還可以外部“轉板”，確屬資本市場首創。
具體來說，企業掛牌12個月，也擁有創新層身份，符合第15條規定的財務條件之一，而且預計自己公開發行以後市值能達標的，就可以申請公開發行並進入精選層。發行完成後，各項指標符合16條規定的，企業就必須進入精選層（不可以選擇哦！）。相反，視為發行失敗，企業“哪兒來的回哪兒去”。
但是進入精選層後並不是“一勞永逸”的，監管層和市場對精選層企業的考察是“全方位、立體化”的“持久戰”，財務狀況如果急劇惡化（2年虧損、淨資產為負）、股權分散度不再能支撐股票連續競價（收盤價低於每股面值、公眾股東持股比例低）、企業變成了“壞孩子”（不披露年報半年報、嚴重違規被處罰），都會被“踢出”精選層。
那這些企業去哪裡呢？一般情況，如果符合創新層條件的，直接進入創新層（第28條），特殊情況（財務造假被調出），直接去基礎層待著，待夠日子再說（第26條）。
降層機制一定是為了保障精選層企業的整體質量，所以讓什麼樣的企業退出精選層，不算是一個難題，比照進入條件設置的高一些、嚴一些就好。但是降層機制的設置，並不可以只需要考慮這一個因素。如果不關注市場整體企業層級的穩定性，那麼企業經營和市場情況的波動，隨便哪一個都有可能導致企業所在的層級頻繁變動，對於投資者而言，今天是精選層，連續競價，明天是基礎層，企業選擇換成做市交易，後天進了創新層，做市商退出了，股票集合競價一天撮合25次，試問哪個投資者搞得清楚弄得明白？
再加上投資者門檻也有差異，每個投資者難以判斷自己買的股票“明天”在哪裡，這樣的市場參與起來也未免太過艱難和複雜。所以即使現在精選層還未設立，也能明顯發現，降層條件的設置是按照“底線思維”，忍無可忍了才“分手”，既穩定了各方預期，保證了企業層級的穩定，也能清除已不再符合精選層要求的企業，保障了市場整體質量。
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