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食用菌的菌種，按種植用途劃分，可分為原種、母種、栽培種。按存在狀態劃分，可分為液體種和固體種。每類種子的取得，都需要接種，除原種外，其他種子的取得都必須經過接種來完成，不知題主，指的是哪個過程。下面我就最接近種植過程的，食用菌種植中最後一次接種，做一下敘述。
這裡所說的最後一次接種，就是把栽培種接入出菇的菌袋之後，就進入養菌、出菇過程的這次接種。
食用菌種植過程中，雜菌感染是種植者最為擔心的問題，因為它帶來的危害最大，所以預防汙染充斥著種植的整個過程，當然，接種也不例外，並且是種植中防汙染的關鍵一環，是重中之重。所以要想降低汙染，必須做到以下幾個方面。
一，菌種的選用。
①挑選。用於接種的菌種，一定要千挑萬選，真正的確認，不存在染菌的絲毫跡象，才能確定做為被使用的對象。
②運輸。菌種在運輸過程中，一定要密閉打包，避免和外界有任何接觸。到達使用地點後，一定要存放在經過嚴格消毒滅菌的場所存放。並在此場所中，最短存放48小時，經觀察，沒有被汙染跡象，方能使用。即使是場所內運輸，也應經封閉後，在進行移動。
二，接種場所。
有條件的，一定要在專門場所，接種箱內進行（因專業非普遍不做詳解）。無條件的，也要搭建簡易帶有更衣室的接種場所，經過硫磺燻蒸，紫外線照射，臭氧輻射等幾項滅菌消毒步驟，才能使用。一般用乾淨的塑料布搭建。
三，接種人員及工具。
①人員。人員進入接種場所，必須在更衣室更換經消毒滅菌的作業服（包括鞋帽），戴好口罩、帽子，並用酒精擦拭雙手，方能進入。
②工具。進入接種場所的所有工具，都必須經過滅菌消毒，並於使用前，用酒精進行再次擦拭，方能使用。
四，接種操作。
①菌種處理。對用於接種的菌種，打開袋（瓶）口時，要先用酒精擦拭袋口和繫繩（瓶蓋，重點是瓶蓋與瓶的接口），在倒出菌種，菌種要用多少，倒出多少，倒出後要立即使用，儘量避免與空氣接觸的時間。
②接種後處理。接好菌種的菌袋，要立即紮緊，或用專業套環及封貼覆蓋，實現與外界隔離。
③接種時，儘量避免人員走動，非走動不了，動作要輕，以免有灰塵出現，菌袋或菌種受到汙染。
食用菌種植過程，可以說就是一個防汙染的過程。在這個過程中，細心謹慎最為重要，這是每一個種植者都要經歷，且必須遵守操作規程的關鍵。否則，就會給自己帶來損失，就是對自己的不負責任。
初始農人
採用以下5種方法，可降低接種汙染率。
一、瓶裝發酵料在培養基的上方離瓶口4釐米處裝入1～2釐米深的發酵料，再滅菌。其優點是雜菌不易浸染培養基，並且菌種的菌齡一致。
二、麥粒發芽法讓麥粒發芽後再裝瓶滅菌。即一次性讓做菌種的麥粒發芽，芽的長度麥粒的1～2倍，再充分曬乾貯存。在做菌種的1天，浸泡麥粒12小時，直接裝瓶滅菌。其優點是省去煮麥粒的過程，發菌快，雜菌少。汙染率在2%～3%。
三、使用液體培養基傳統菌種培養採用的是固體培養基，固體培養基的缺點是發菌慢，菌齡不一致，雜菌浸染的幾率。改進的方法是使用液體培養基，就克服了固體培養基的缺點，可以直接把用液體培養基培養的菌種作為栽培種進行栽培，汙染率可降至2%。
四、從原種瓶的下部接菌原種瓶下部的菌種菌齡短，生命力旺盛，並且雜菌少，接種後菌絲吃料快，汙染率低。建議將正常原種瓶口上部1/5的原種棄掉，汙染率可降至3%。
五、合理安排制種季節在高溫潮溼環境中，雜菌蔓延快。改進方法是在氣溫較低的時間接種，如早晨或晚上。如果在有空調的室內接種效果佳。
