Tips：
- 北美有更多的流行譜系（lineage）
- 北美開始出現“RFLP 1-7-4”新近流行株，堪稱北美HP。
- ORF5 的RFLP 1-7-4酶切模式跟致病性無關。
國際化勢不可擋，養殖也不例外，由於我們的市場規模和發展需求，吸引著大量的技術和商品輸入。美國尤盛，當前在國內紅火的兩大外資背景的農場託管諮詢公司以及知名豬界“白求恩”都來自美國。外來的和尚會念經，外國的月亮比較圓，當然關注小蘭的人應該更能體會外來的毒株會暴發。雖然至今還沒有足夠的證據表明CH-1a這個最早的分離株是否來自美國，但至少NADC30-like毒株的引入是板上釘釘的事。老外最喜歡戲謔的打趣說，病毒都是“偷渡客”，從來去哪都不申請簽證（VISA）。那我們今天就抱著看熱鬧不嫌事大，鹹吃蘿蔔淡操心的心態扒一扒美國那個屯的“美蘭疫事”，也許能學到點什麼，知道提防著什麼。
【美蘭多門派】
每次大家介紹我國PRRS流行情況的時候都喜歡說我們具有豐富的毒株多樣性和廣泛的毒株變異，我們VM上的綜述文章也總結了有至少23種nsp2缺失模式，但如果用基於ORF5進化樹的分類標準來看，美國才是流行毒株種類最多的國家。在9個譜系（lineage)中有7個含有北美洲的分離毒株，而我國只有譜系1（NADC30-like），3（FJ-1)，5（BJ-4)，8（HP，CH-1a),而大部分變異都在lineage 1和lineage 8 裡面，從宏觀的角度來看也可能說明大量疫苗免疫的免疫壓力貌似沒有壓在ORF5上，或者不算太大（僅為猜想，尚無數據）。美國上世紀80年代末首發，當時除了分離到VR-2332（type2 原型株），1989-1992年間還有一批同期分離株，但那一疫之後，譜系5就不行了，風頭馬上被別的毒株掩蓋，淪為了非主流。從mang SHI的進化樹上也能看出來當年lineage 1和lineage 9都是2000+的毒株數，lineage 8的1400，這幾年咱們HP和NADC30-like毒株流行相信對lineage 1和8的貢獻會更大。
尤其說一說lineage 1的毒株，大部分來自加拿大的魁北克（楓葉國是PRRSV陽性血清有記錄的最早發現地），這些毒株都在進化樹的根部（root）起源較早，此外，2001年nsp2內有131aa缺失的MN184及其變異株在美國暴發也是lineage 1的毒株，後面和lineage 9 成為北美的重要流行毒株，但具體誰更多我還不太清楚。---原來這麼多年美國一直在為小蘭發源地這一罵名背鍋，加拿大偷笑不語。
【美蘭新流行】
在美國豬場由於沒有沒有豬瘟（通過國家計劃法案，淨化清除了）偽狂犬，藍耳無疑成為北美（甚至整個美洲大陸）最為喪心病狂的top豬病。美國豬場的藍耳發病主要表現為母豬的繁殖障礙，斷奶和保育豬的死淘率增加，但沒有HP-PRRSV感染那樣的急性大規模死亡。幾年前有建模統計美國藍耳引起的直接經濟損失在6.4億美元左右，但真正統計繁殖障礙造成的損失缺只佔12%左右，呼吸道疾病的損失更大。
近幾年內美國有一類叫做RFLP 1-7-4的毒株開始新近流行，這個毒株最早在2014年左右發現，它應該是由RFLP1-8-4（比如MN184）那一類毒株演化而來，最大問題是除了更嚴重的繁殖障礙（ Dramatic Abortion “Storms”），哺乳豬的死亡率提升，它的最猛的地方是能夠引起母豬群出現死亡率，育肥豬死亡率上升到50%，專家驚呼，這不就是美國HP-PRRSV嗎？而且它引起的發病很多甚至是疫苗免疫做的很好的豬場。該毒株目前主要在一些養殖密度比較大的區域出現流行，而且一旦發病之後，以前的控制方案失效，豬群恢復到穩定階段所需要的時間遠遠超過原來毒株所導致的疫情。從下圖進化樹可以看出這一類毒株在田間應該是開始大量流行了，這樣的疫苗扛不住的毒株在豬群中的情況，我們最熟悉了。
為了瞭解RFLP1-7-4這類毒株分子特徵以及致病性，來自美國農業部的/韓帥和袁世山老師的導師/發現NADC30的/傑出斜槓女科學家/KayFaaberg又出手了。她的研究表明RFLP1-7-4這類毒株同源性在81.4% to 99.8%之間，重組分析發現毒株在結構蛋白和非結構蛋白中存在譜系（lineage）間重組（重組出品，必是精品）。其毒株nsp2內的缺失模式也不相同，有和NADC30相同的131aa缺失，但大部分是有獨特的100aa的缺失（對應VR-2332 的328-427位），有的除了100個缺失之外還有缺16aa，缺32aa， 缺13aa的還有插入9aa的，總之nsp2有明顯突變。—一句話基因組各式各樣。
她選了4個代表毒株和以前的一箇中等毒力的毒株SDSU73，比了比致病性，發現其感染後的發病情況也是不一樣的，像A/2014/NADC34,IA/2013/ISU-1and IN/2014/ISU-5就比較厲害，而IA/2014/ISU-2在豬體內基本不怎麼漲。所以說RFLP-174的酶切模式跟致病性並沒啥關係，只是正好新近厲害的流行毒株多是這個模式。
通過看了那麼多變異毒株，自己總結了一個規律，凡是沒節操，愛缺失，易重組的毒株，致病性及危害都低不了。—這就是病毒複製保真性影響病毒致病性的粗獷推演。
【南美新動向】
pig333上有人對愛爾蘭 IPVS2016大會上拉美地區的PRRS研究報告做了個總結，雖然都是個案，但管中窺豹，也算能見到一斑。
墨西哥
J. Segalés教授（我們2018 IPVS的keynotespeaker）對墨西哥的Bajío 地區37頭有消瘦體質的豬隻進行剖解和分子診斷。
發現有間質肺炎的68%，38%的有不同程度的淋巴器官水腫和充血。分子檢測發現這些豬隻中墨西哥三大病毒病圓環，藍耳和藍眼病（哈哈，沒怎麼聽過吧，藍完耳朵藍眼睛。porcinerubulavirus-PoRV，Mexico獨享）的陽性率分別為PCV2（43%），PRRSV（49%）和PoRV（3%），藍耳居然陽性率比PCV2高，兩個共感染率在19%左右。國內可能只要有PRRSV的PCV2基本跑不了，只是引不引起發病的問題。另外一個報道則表明公豬陽性的農場32%左右，自繁自養模式（self-replacement）的PRRS陽性農場在調查農場的在65.22%，而後備豬的血清陽性率在44.21%左右。
智利
1999年第一次報道了美洲型毒株的暴發，一直在搞控制和進化，2013年2月宣佈（Self-declare，感覺到了pig333作者的不懷好意，呵呵）全國範圍內清除PRRS，結果8個月後又發case，測序結果表明，還是先前的本土毒株。不是外來引入，引起暴發。
哥倫比亞
哥倫比亞的毒株比較有意思，從1996首次報道以來，這次研究人員把1998年到2014的毒株都分析了一遍，發現同源性極高91.2%-99.8%之間，都屬於根紅苗正的lineage5（VR-2332在的那個譜系），因為他們MLV僅僅用到2004年所以，缺少大規模疫苗免疫，宿主對野毒的選擇壓力不大。還是我們的選擇壓力山大—V5。
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中國農業大學動物醫學院
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