第一部，《高達Seed》
故事發生的背景是作為普通人類的自然人和調整者之間溝壑日益加送，最終調整者離開了地球，開始移居到新世代的太空殖民地。組成了軍事組織扎夫特，在這裡背景下調整者“基拉”突然被捲入戰火中，在扎夫特士兵中，基拉發現了好友阿斯蘭，之後阿斯蘭奪取了聖盾高達，基拉不得不為了保護同伴而出擊。字詞之後他們的命運也與戰爭深深牽扯在一起。
動畫標題中SEED的含義是將劇中的人類分為兩大陣營的遺傳基因。
第二部，《鋼之鍊金術師》
所謂的鍊金術，就是以“等價交換”為原則，物質的理解、分解、然後再構築的這個世界上最先端的科學學術。在鍊金術的領域中，最大的“禁忌”就是“人體煉成”。因為思念已故的母親，失去了一切的年幼的兄弟打破了禁忌。
裝著機械鎧的，揹負著“鋼之鍊金術士”之名的哥哥，愛德華·艾爾利克，靈魂附著在巨大的鎧甲上的弟弟，阿爾方斯·艾爾利克。兩人為了奪回失去的東西，開始了尋找“賢者之石”之旅。
隨著兄弟兩人離“賢者之石”的真相越來越近，也不斷地被捲入巨大的陰謀的漩渦之中。
幕後操縱的強大陰謀者的存在。漸漸地露出本性的軍事國家亞美斯多利斯受虐的民眾的無止盡的憎恨和復仇的意念。鍊金術招致的無數悲劇。散在的悲劇最終連成一條線，將人們，民眾，甚至國家全部捲入其中。
即使處於絕望和希望的狹縫之中，艾爾利克兄弟依然繼續前進。
第三部，《浪客劍心》
故事講述在幕末年代一位擁有一身絕世劍術的劍客為平亂世，加入改革陣營刺殺敵對陣營首腦，人稱“拔刀齋”，殺人無數。維新之後依然收到手持逆刃刀流浪天涯。在東京的神穀道場，劍心遇到了阿薰及一幫朋友們。他是否找到了呢——劍的方向，心的歸屬。
逆刃之劍，也許是想就這樣悄悄的藏住自己的鋒芒的，可是劍終歸是劍，能夠出鞘的劍就更沒有理由來說自己已經把自己隱藏得很好。
也許是想避開那些權利的爭鬥，也許是想避開無謂的紛擾，可是拔刀齋始終是屬於那個一開始就被叫做拔刀齋的人，就算有人能夠繼承，就算別人能夠搶去這樣的名號，但是人們提起這個名字，腦海裡還是一個火紅的背影。
第四部，《通靈王》
故事講述出生在通靈世家的麻倉葉，從小即由爺爺教導成為通靈者，並因和爺爺的一次交談中得知參加了通靈王大賽並勝出，即能得到精靈王，並可完成自己的任何願望。從小就希望能夠每天輕鬆聽著音樂，過自己喜歡的日子的葉為此而立志，努力成為通靈王……
為尋找持有靈和修煉靈力，葉轉學到了踏張之丘。並認識了第一個好友小山田萬太，誤闖入當地流氓木刀之龍的最佳地點，從而發生衝突，但最後因600年前的武士阿彌陀丸與葉的成功合體，而輕易打敗了龍。在葉的幫忙下，阿彌陀丸也了結了600年來的心願，並願意成為葉的持有靈，葉的通靈王之路由此展開。
一路上遇見許許多多同伴，連之前發生衝突的木刀之龍都成為通靈者一同比賽。
可沒想到最後的BOSS是麻倉葉的孿生兄弟麻倉好，實際上麻倉好為千年前打陰陽師麻倉葉王，轉世到今就是為了奪取精靈王，葉將怎麼打敗這麼兄弟呢。。。
第五部，《棋魂》
小學六年級的學生進藤光，無意中跑到爺爺家的閣樓上，發現了一個古棋盤，但是從古棋盤中出現了一個千年前的靈魂，從此附在了光的身上，利用光完成自己下圍棋的夢想，光也在對弈的過程中喜歡上了圍棋，還遇見了這輩子的好友加宿敵，塔矢亮。塔矢亮盲目追逐著光背後的佐為，光也在追逐著亮。
佐為以為是神讓自己領悟神之一手才多次轉世，但佐為和塔矢行洋大戰後，被光發現了至關重要的一步，才知道他的出現是為了讓光看到這盤棋。
第六部，《網球王子》
進入網球名校——青春學園初中部學習的越前龍馬，在美國青少年網球大賽上連續四次獲勝，被譽為網球天才少年。越前龍馬在青春學園網球部中遇到了實力強勁的前輩們，但他以驚人的實力，最終贏得了前輩們的認可正式加入了校隊，開始了通往全國大賽的奮鬥之路。
第七部，《鬼眼狂刀》
講述了戰國末期,在這亂世之中,有一場決定最後勝負的戰爭,那就是後人稱為關原之戰的大對決,嘶殺聲如雷鳴般交織怒吼,漫天血雨中,無數的生命消失了… 其中,以劍為生存意義的劍客們,並不在意戰爭情勢的發展,只是為了提高自己的本領,而活在劍的世界中,終以拼鬥而之.在那段歷史間消失的豪傑中,有一位公認所向無敵的俠客……
第八部，《新世紀福音戰士》
神作中的神作，故事劇情描述的是一個有關”第二次衝擊”的記事:公元2000年有顆巨大的隕石墜落在南極冰山附近,高溫造成部分冰塊溶化,連帶使得全球水位上漲,接下來的天災人禍更是連綿不斷。
公元2015年又出現了新的入侵者,一種似人的巨大機械戰鬥群,人們將之稱為”使徒”,大概是影射他們是上帝派來的使者,要來消滅作惡多端的人類吧!
人類此刻的各種軍事武器對使徒可說是毫無用處,為此,當時地球的政治中心決定重用NERV這個組織,他們以最精密的技術,花費巨資研究出一種以駕駛員的神經直接控制的”泛用人形決戰兵器”(EVA),這種高科技產物將駕駛員與機器做了精細的契合,籍由意志及身體的反映來控制EVA.
不過由於當時這些技術還在研發階段,所以有許多障礙還無法立即克服.而且因為並不是每個人都能自由的駕駛EVA.駕駛人選一直是NERV最頭疼的地方,除了符合條件的人難覓,而且還必須經過幾個月訓練才能和EVA達到同步活動的基本能力.而後，在世界上發現了3名可以駕駛EVA的少男少女，人們把希望都寄託在了他們身上。
第九部，《閃靈二人組》
美堂蠻和天野銀次都是擁有特別能力的人。美堂蠻有一雙邪眼，他可以讓人看到幻像，是讓人看到噩夢般的幻像，還是看到幸福的幻像都是因他自己的意志來決定的，此外他還有“SNAKE BITE”這種能力，即是以200KILO的握力把敵人撕裂。而天野銀次的能力就是在他的體內潛伏有高壓電流，就象是電鰻一樣最高可達到10萬伏特，不止可以讓人類的知覺麻痺，還能破壞電子儀器，用途非常的廣泛。
他們擁有這種天賜的能力從事“奪回者”這種工作，不只是說奪取，還為了取回。把委託人被奪走的東西取回來就是他們的工作，但即使有多麼特殊的能力，他們做的工作的危險性是很高的，因為他們不是不死的超人，有時他們所付出的努力未必能得到相應的回報，但他們還是繼續經營“奪回公司”。所以他們不只為了“奪取”而使用自己的能力，而是為了“取回”而使用的。重要的是為了讓某人取回他的笑容。
更重要的是在奪還自己以及朋友的未來，一路上探索、挑戰無限城之神的秘密。為了大家的幸福而努力著。
第十部，《最遊記》
改編之《西遊記》的日本漫畫作品。
天地混亂的混沌時代--有一塊人和妖怪共存的土地，那裡是文明和信仰之源--桃源鄉。突然的異變和恐怖襲擊了那土地，以往平穩生活著的的妖怪們失去了自我開始了暴走。異變的元兇是“將過去的大妖怪牛魔王給復活了”這件事。
由於在這個世界上被禁忌著的科學和妖術，現在牛魔王的復活要被完成了，負波動覆蓋著大地。
看重這事態的天界，下達了請唐三藏去阻止牛魔王復甦實驗的命令。同那不怕負波動的三人，孫悟空，沙悟浄，豬八戒一起前往遙遠的西天·天竺國的旅行開始了。
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