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要想魚兒健康的在魚缸中成長，過濾方式的選擇固然重要，針對好的過濾方式以及濾材的選擇和擺放，我們來談談這方面的方法和經驗。
首先簡單的介紹下基本過濾方式的功能及機理，魚缸過濾要把物理、生物、化學過濾結合起來才能更好地發揮作用。
一、物理過濾功能：是以濾棉的絮凝作用，吸附懸浮或沉積在缸中的肉眼可見的顆粒物和部分活的微生物。這些東東不但能引起水渾濁，影響觀賞，還消耗水中氧氣，黏附在魚身上，對魚的鰓部也有一定的破壞作用。主要材料：各種過濾棉。
二，化學過濾功能：通過化學反應方式來消除水中廢物和有害物質。反應後產生的無毒沉澱經物理過濾排出缸外，或轉化成一些無毒或毒性相對低的元素。主要材料：水質穩定劑、PH調節劑、清水劑等。另外，活性炭也是一種化學過濾材料，還有吸氨氣的石頭等等。
三、生物過濾功能：魚每天的新陳代謝，首先會被缸內的細菌分解成有毒的氨鹽和亞硝酸鹽，達到一定濃度，可以致魚中毒死亡。只有讓這些有毒物質保持在較低的範圍內，才能保證魚的生存，一個解決辦法是經常換水，另外就是生物過濾。生物過濾就是使用帶有不同孔隙、大空隙可以讓水順暢流過，而小孔隙則供硝化細菌附著，給硝化細菌提供良好的生長、繁殖溫床，讓硝化細菌能夠更好的繁殖、生長。然後通過多重生化過程，讓其分解有害物質為無害的物質。有一點需要注意，硝化菌是“高氧厭光”菌，怕光，還需要大量氧氣，所以把生化材料直接扔到缸底是沒什麼效果的，只能吸附滿厭氧菌，大肆製造有害物質。主要材料：生化棉、生化球、過濾環、珊瑚砂、細菌屋等。
濾材的使用有很多講究及門道，錯誤的使用方法不僅會影響正常的硝化系統的建立，並且會無形之中增加大量的人力負擔，即便是增加了更換的頻率，有些時候效果是不一定好的，所以我們要詳細瞭解濾材的作用以及選擇方法，這是一個至關重要的問題。
濾棉是最基本的使用率最高的過濾材料，不管是哪種的過濾器，基本都是必不可少的，主要的功能就是過濾掉水中魚的排洩物等大量的廢物，將他們從魚缸中過濾出來，也讓後面其他的濾材發揮作用。
生化棉也是一種使用範圍很廣的濾材，主要是起到生化過濾的效果。相對於濾棉來說密度大，不容易損壞，而且要厚得多，這樣就有足夠的空間來寄生硝化細菌。而且也可以過濾掉一些大的異物，所以可以說生化棉是物理過濾及生化過濾都有的一種濾材，但因為一般生化棉的上面為濾棉，所以物理過濾有限，生化棉被廣泛的應用到上濾，外置，內濾過濾器當中。
細菌屋，生物淨化水質，增加魚兒所需的微量元素，促進魚兒新陳代謝。爆孔式螺旋細菌屋具有高滲透性和吸水性，表面可以培養好氧菌，裡面可以培養厭氧菌，螺旋狀結構極易形成漩渦抽動細菌屋內外，更有利於好氧菌與厭氧菌的平衡，從而保證長期有效生物淨化功能。
火山石，具有天然的蜂窩狀孔隙，是硝化細菌的最佳寄生環境。而且對水流阻力小，不宜堵塞，表面粗糙，即使水流很快，寄生在上面的硝化細菌也不會脫落，加上其硬度高，使用壽命比其他濾材都要長，是硝化細菌的良好溫床。
陶瓷環、玻璃環是目前使用率和普及率最高的生化濾材，因為採取不同的原材料燒製而成，所以有不同的稱呼，陶瓷環屬於比較早期的產品，由於其功效有效，現在逐漸的被玻璃環取代。現在也延伸出來很多不同的品種，普通玻璃環，呼吸玻璃環，根據大小不同，又出現大環，小環，包括瓷珠等等，不過主要的原理都是一樣，就是利用其特殊的結構，孔隙來寄生更多的硝化細菌。但不具備物理過濾功能，所以一定要使用在濾棉這樣的材料後面。
生化球一般採用塑料製成，多數為球形，方形，或不規則形狀，很多突起，黑色。生化球也是一種使用比較廣的生化濾材，現在又新推出了內部帶有生化棉的，但使用的範圍有限，其特殊的結構造成在很多過濾方式當中並不適用，不能發揮很高的效率，在外置，內置，上部過濾器當中就不適合使用，使用了會使生化效果大打折扣，一般最適用的是滴流過濾器，使用的時候儘量不要把生化球全部泡在水中，而是讓水流從上面衝過，這樣帶來更多的氧氣，寄生更多的硝化細菌，從而能夠達到更好的生化效果，不過要有一定的生化球數量才行。
珊瑚沙為珊瑚蟲死亡後留下的骨骼經過長年的積累而形成，珊瑚蟲死亡後，留下很多小的孔隙，一般結構比較緊密，通透性較強，其內部結構適合寄生各類的硝化細菌，當水從其上面流過的時候，寄生的硝化細菌就可以達到生化過濾的效果了。珊瑚沙成鹼性，所以並不是所有的缸都適合，一般適用於偏鹼性的水體，如三湖慈鯛缸，不但可起到生化過濾的作用，還可以起到穩定偏鹼性水質的效果，在海水缸的過濾當中也被大量的使用
麥飯石因其內部含有很多種有益的可溶性的微量元素，在早期在人用的飲水設備中被大量的使用，在國外很早以前就被應用於水族箱的過濾系統中用來調節水質。國內近幾年才開始時興起來，多數人還沒認識到它的重要性。麥飯石具有很輕的吸附能力，對水的PH值具有雙向的調節作用，並釋放出大量的有益微量元素，對觀賞魚的養殖，幼魚的孵化等各方面有很大的好處，使用的時候，放在等同玻璃環的位置即可。
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