EDI與現有的一些通信手段，如傳真、用戶電報（Telex）、電子郵件（E－mail）等有著很大的區別，其基本特徵主要體現在以下幾個方面：
（1）EDI傳輸的是格式化標準文件，並具有格式校驗功能。而傳真、用戶電報和電子郵件等傳送的是自由格式的文件。
（2）EDI是實現計算機到計算機的自動傳輸和自動處理，其對象是計算機系統。而傳真、用戶電報和電子郵件等的用戶是人，接收到的報文必須人為干預和人工處理。
（3）EDI對於傳送的文件具有跟蹤、確認、防篡改、防冒領、電子簽名等一系列安全保密功能。而傳真、用戶電報沒有這些功能。雖然電子郵件具有一些安全保密功能，但它比EDI的層次低。
（4）EDI文本具有法律效力，而傳真和電子郵件則沒有。
（5）EDI和電子郵件都是建立在分組數據通信網上，而傳真是建立在電話線路上，用戶電報是建立在電報網上。
（6）EDI和電子郵箱都建立在計算機通信網開放式系統互聯模型（OSI）的第七層上，而且都是建立在MHS通信平臺之上，但EDI比電子郵箱要求的層次更高。
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