新發和再發傳染病
此類疫病傳播迅速、危害大，有的病原不明，暫無疫苗供防控。如，當前的非洲豬瘟、雞的肝破裂綜合徵等。對於此類疫病，採用接種疫苗所起的作用很小（一般不考慮）。此類疫病發生，需要採取及時撲滅和嚴格的生物安全措施。撲滅原則是“早快嚴小”。
早，即嚴格執行疫情報告制度，及早發現和及時報告動物疫情，以便畜牧獸醫行政管理部門能夠及時地掌握動物疫情動態，採取撲滅措施；
快，即迅速採取各項措施，防止疫情擴散；
嚴，即嚴格執行疫區內各項嚴厲的處置措施，在限期內撲滅疫情；
小，即把動物疫情控制在最小範圍之內，使動物疫情造成的損失降低到最低程度。
美國2014-2015年發生了H5N8禽流感，造成了幾十億美元的損失，疫情波及了20幾個州，但最後被撲滅了。因此，對新發病應採取及時撲滅措施，國內在此方面還有很大提升空間。
新發病應第一時間報告疫情，採取果斷措施，消滅傳染源，切斷傳播途徑；同時也要禁止動物產品的流通，採取從隔離到封鎖等舉措，最後是謹慎使用疫苗。
這樣的策略在國際上是通用的，在經濟上最合算。因此，國內養殖業疾病防控要朝著這樣的方向走。
垂直傳播疫病
種群在垂直傳播疫病傳播中起著重要作用，這類疫病沒有可預防的疫苗或者可用疫苗效果不理想。如禽白血病、雞白痢、雞毒支原體（MG）和雞滑液支原體（MS）。
採用疫苗接種來防控垂直傳播疫病，其作用很小（一般不考慮），其防控措施主要是進行種群淨化、強化生物安全。
重大動物疫病
這類疫病已在我國呈常在性地方流行態勢，如古典豬瘟、口蹄疫、高致病性禽流感（HPAI）、新城疫（ND）、高致病性豬藍耳病（PRRS）。其防控措施需要強化生物安全，科學使用疫苗，實施根除計劃，從免疫無疫過渡到不免疫無疫。
採用疫苗防控對此類疾病的作用比較重要，但不能濫用疫苗，需要科學減負，需要創造條件做種群淨化，做根除的規劃。不然，老病不除，新病不斷出現，病最終只能越來越多。
近幾年來是我國新城疫防控得最好的時段，在全國範圍內已很難分離到一度流行的基因Ⅶ型強毒，建議國家不失時機制定ND根除規劃，實現從免疫無病到不免疫無病的過渡。
傳播效力高的呼吸道疫病
這類疫病的典型特徵是普遍存在且傳播迅速。如H9N2亞型禽流感、雞傳支。其防控策略是強化生物安全，科學使用疫苗。疫苗在這類疫病中有重要作用，但同時要強調科學減負，適當減少免疫次數和疫苗用量。
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