漫威電影宇宙第一階段以滅霸最後的迷之微笑收場，初步奠定了滅霸作為漫威系列電影幕後反派的基礎。主要讓最初的幾個復仇者在個人電影裡出現然後再首次集結，穩紮穩打基本上主要角色是一人一部電影。第一階段的電影風格整體上相較於第二三階段來說相對保守，對於宇宙其他星球的故事線主要以神話為主，除了紐約之戰的齊塔瑞大軍之外沒有出現其他天馬行空的外星種族。
第二三階段，後續為大家一一展示。
第二階段：新世界開啟
《鋼鐵俠3》
紐約大戰兩年後託尼出現焦慮症，斯塔克開始思考鋼鐵戰衣的存在意義。著名鋼鐵俠宿敵滿大人首次露面，並在結尾處證實為傀儡，幕後主使人是基裡安博士：使用絕境病毒的科學家。
鋼鐵俠軍團首次出現，但最後又被斯塔克全部銷燬。好友羅迪上校的MK2號首次以鋼鐵愛國者身份出現。史塔克在中國醫生的幫助下取出了胸前的彈片，他再也不用依賴胸前的反應堆了。最後布魯斯班納博士出現在斯塔克旁邊，此處應是在鋪墊斯塔克的下一個科學計劃：人工智能奧創。
《雷神2：黑暗世界》
雷神故事線。第三顆無限寶石以太粒子現身，為現實寶石。黑暗精靈瑪勒基斯借宇宙九大國度連成一條線的機遇妄圖通過現實寶石控制宇宙，最後失敗。洛基藉助奧丁力量虛弱期間成功篡奪王位，雷神托爾因與地球人簡·福斯特相愛選擇放棄王位而生活在地球。劇漫威短片介紹雷神托爾去了澳大利亞和一個普通地球人生活在一起。
而以太粒子也就是現實寶石因兩顆寶石不能放在同一個地方的理由被送到了宇宙神秘人收藏家那裡存放起來。收藏家提到，類似的無限寶石一共有六個。雷神故事線開始從普通的神話逐漸轉變帶有太空性質，電影開始提到其他外星種族諸如九大國度。並且阿斯嘉德人的戰鬥也是用宇宙飛船，漫威開始慢慢把神話和太空結合起來。收藏家一族首次出現。
《美國隊長2：冬日戰士》
地球故事線。美隊和黑寡婦依然為神盾局效力，而此時神盾局內部已經被九頭蛇佔領。美隊羅傑斯的摯友巴基確認未死亡且被洗腦改造為超級士兵，擁有一隻金屬手臂，並以冬日戰士的身份效力於九頭蛇。前傘兵救援部隊的特種兵山姆以獵鷹的身份加入美隊團隊：獵鷹出現。
神盾局再次生產出第二代天空母艦，後全部被摧毀。神盾局全面瓦解，神盾局掌握的最重要的心靈寶石也被九頭蛇殘黨帶走，並由斯特拉克伯爵開始進行人體實驗。彩蛋顯示僅有的兩個成功的實驗對象為快銀和緋紅女巫。
《銀河護衛隊》
宇宙故事線。1988年，地球小男孩皮特·奎爾被外星海盜掠奪者勇度帶走從此生活在宇宙中。（地外種族早就知道地球的存在，而地球直至紐約大戰之前並未官宣有地外種族的存在，再一次證明地球的特殊性。）長大了的皮特·奎尓號稱“星爵”，並找到宇宙靈球——出現的第四顆無限寶石力量寶石。後同滅霸的養女卡魔拉，賞金獵人火箭浣熊和樹人格魯特，毀滅者德拉克斯五人組建“銀河護衛隊”，擊敗了想摧毀山達爾星的克里人激進分子羅南。
山達爾星的新星軍團首次出現。樹人格魯特為保證其他隊員安全而犧牲。其中宇宙泰坦滅霸首次正面出現，並表現出想得到無限寶石的意圖。最後，星爵成為第一個接觸力量寶石卻沒有死的人，星爵血統成迷。其中擁有以太粒子的宇宙收藏家再次出現，與雷神聯動構成太空故事線。力量寶石被星爵送至山達爾星保存起來。彩蛋中樹人格魯特的樹枝發芽，成為小樹人。
《復仇者聯盟2：奧創紀元》
復仇者們再次集結，摧毀了位於索科維亞的九頭蛇殘黨斯特拉克伯爵，並找回了被九頭蛇帶走的權杖——心靈寶石。史塔克和班納博士利用權杖製造保護全人類的人工智能奧創，不料奧創不受控制成為想消滅全人類的反派。快銀和緋紅女巫先加入奧創，後得知奧創的真正目的後加入復仇者。
鋼鐵俠第一次出動反浩克裝甲與浩克正面對決不分伯仲。奧創利用韓國科學家趙博士（漫畫中趙博士為下一代綠巨人的母親）的再生搖籃，並找到黑豹中的反派尤利西斯·克勞購買振金製作出振金身體（本片已經開始提及非洲擁有振金的國家瓦坎達）。
振金身體被複仇者搶奪並注入賈維斯的意識和心靈寶石，幻視誕生。在最後撤離索科維亞群眾的時候，局長尼克弗瑞出動了《復仇者聯盟》中的第一代天空母艦幫助撤離，並帶來了戰爭機器加入戰鬥。最後奧創戰敗，快銀為救鷹眼倒下了，心靈寶石留在幻視額頭上，鷹眼因為有了家庭選擇隱退。
綠巨人因為懼怕自己的力量乘坐昆式戰鬥機不知所蹤，雷神托爾表示這是近年來出現的第四顆無限寶石，一定有某個人在背後操縱這一切，於是決定返回阿斯加德開始調查此事。片尾彩蛋顯示獵鷹、戰爭機器、緋紅女巫、幻視四人成為新的復仇者，另一邊滅霸拿起無限手套準備親自動手了。但是奧創的出現到底是不是滅霸背後操縱的結果，有待以後的系列電影解答。
漫威電影宇宙第二階段結束，再次以滅霸的行動收場，這次是拿起了無限手套準備親自行動了，但是行動的第一站並不一定就是地球而應該是除地球以外的擁有無限寶石的勢力：比如收藏家和山達爾星。
第二階段主要為觀眾打開了漫威宇宙新世界的大門，把雷神的神話線和銀河護衛隊的太空線結合得更加緊密，並且雷神目前成了地球獲得宇宙中重大消息的橋樑，地球在漫威宇宙中的位置顯得更加特殊，第二階段結束時復仇者聯盟的隊伍已經逐漸壯大起來，人更加多的隊伍中理念難免出現分歧，這也成為內戰的導火索之一。
第三階段，明日為大家續上！
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