胎兒期是腦發育的重要時期，由於胎兒的大腦發育需要甲狀腺激素，尤其在妊娠早期，即妊娠的前12周，處於胎兒腦發育的第一快速發育期，但此時胎兒自身的甲狀腺功能尚未建立，胎兒腦發育所需要的甲狀腺激素完全依賴母體供應。如果準媽媽在這時患甲減，就不能為胎兒腦發育提供充足的甲狀腺激素，將會影響胎兒腦發育和出生後的智力，甚至造成不可逆的損害。因此，準媽媽們在妊娠期尤其是孕早期應定期進行甲狀腺功能檢查。
一般說來，母親如果在妊娠時出現甲減，出生後孩子的智力發育和運動能力都會低於母親甲狀腺激素水平正常的孩子。對於發現甲狀腺功能減退的育齡期女性，要及時到相關專科就診，一定在甲狀腺功能正常或在足夠的甲狀腺激素替代的情況下才能懷孕。
中國指南建議下列人群最好在孕前、孕期進行甲狀腺功能篩查：甲狀腺疾病個人史、甲狀腺疾病家族史、甲狀腺腫大、甲狀腺抗體陽性、臨床症狀或體徵、1型糖尿病、其他自身免疫疾病、不孕症、頭頸部放射治療史、流產史和早產史等。
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妊娠期甲減的診斷標準
妊娠期婦女hCG平均濃度與TSH抑制呈負相關，其機理可能是hCG與TSH結構相似，孕早期因hCG升高,當兩者受體結合時可以出現交叉反應。在妊娠8～14周hCG分泌顯著增多時,負反饋刺激TSH受體導致垂體-甲狀腺軸的抑制，使TSH分泌減少。所以妊娠期TSH水平較非妊娠婦女平均約降低0.4mlU/L。因此，對於妊娠期甲狀腺功能減退，應採用特異性的TSH診斷標準：
妊娠早期：0.1～2.5mIU/L，
妊娠中期：0.2～3.0mIU/L，
妊娠晚期：0.3～3.0mIU/L。
在懷孕之後才確診甲減應當立即進行藥物治療。達標時間越早，妊娠甲減對胎兒腦發育的影響也將會越小。左甲狀腺素鈉片（L-T4）是甲狀腺功能減退長期替代療法的首選藥物。研究發現，經過治療的孕婦後代3歲半智商低於85的比例為9.2%，而未治療孕婦的後代這一比例為15.6%。服用正確劑量的左甲狀腺素鈉片是絕對安全的，不影響妊娠和哺乳。因為甲狀腺激素是身體正常分泌的一種激素，服用外源性甲狀腺素只是為了補充身體缺乏的那部分。嚴格來說，它並不能算作是藥物，而只是一種生理性的替代品。左甲狀腺素鈉片（L-T4）的初始用藥劑量根據TSH水平確定：
TSH＞2.5mIU/L, L-T4的用藥劑量50ug/d；
TSH＞8.0mIU/L, L-T4的用藥劑量75ug/d；
TSH＞10mIU/L ,L-T4的用藥劑量100ug/d。
對於出現妊娠期甲減的孕婦應定期檢測甲狀腺功能，建議在妊娠前半期（1-20周）每4周檢測一次甲狀腺功能；在妊娠26-32周應該監測一次甲狀腺功能。
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