1949年8月4日，以程潛、陳明仁在長沙起義為標誌，湖南宣佈和平解放，但此舉並不意味著當地局勢已經平靜。解放前，湘西、湘南匪患就很嚴重，白崇禧集團潰退時又安插、部署下匪交警總隊、匪保1師、匪湘南總隊等50餘股反動武裝，
其與地方慣匪相互勾結，總數達10餘萬人，仍控制著部分城鎮、鄉村，對我新解放區建設及人民財產安全構成很大威脅。蔣還親自從臺灣寫信給湘西匪首，要他們“堅持游擊戰爭”。
為此，湖南軍區於1949年9月5日發佈命令，抽調幾個師的正規部隊，在原湖南地下黨和地方武裝配合下，掩護數千老區幹部下鄉發動群眾，開展生產救災，籌集糧草，修橋鋪路，迅速完成城鄉接管工作，肅清土匪殘敵，安定社會秩序。5天后，湖南省人民軍政委員會召開會議，再次強調湖南當前主要任務是肅清土匪、整頓全省武裝和籌糧支援前線。
剿匪戰鬥開始後，很快捷報頻傳——長沙、岳陽兩分區軍民對竄擾平江、岳陽、臨湘、瀏陽、湘陰之間的流散敵軍及慣匪展開清剿，20余天就消滅土匪5477名，繳獲迫擊炮5門、輕重機槍62挺、長短槍近3000支。10月13至16日，常德軍分區部隊僅用4天時間，就將盤踞桃源的匪暫3師1旅殘部全殲，迫使匪眾681人繳械投降（含少尉以上軍官76人），徹底肅清當地大股土匪。到1949年10月中旬，我軍相繼解放耒陽、衡陽、邵陽、零陵等重要城市及湘南、湘西廣大地區，全省基本解放，只有個別縣城仍為土匪盤踞。
1949年11月下旬，我軍成立湘南剿匪指揮部，重點針對白崇禧集團留下的反動武裝展開清剿。12月初，我軍周密部署，多路進擊，採用遠程奔襲、秘密迂迴、窮追猛打的戰術，先以迅速動作切斷敵竄往廣東的2條路線，後將各路股匪壓縮進廣大包圍圈以利聚殲。我軍動作之迅猛完全出乎匪軍意料，6天即連克江華、臨武、嘉禾、藍山4城。特別是12月6日晚，我軍某部連夜奔襲200華里，擊潰沿途攔阻之敵，一舉突入藍山城，活捉匪湘南總隊副司令以下1300餘人。
之後，我剿匪部隊從四面八方殺入位於嘉禾、臨武、藍山三角地帶的華陰山區，對負隅頑抗的反動武裝主力發動總攻。到12月下旬，我軍已全殲匪交警2旅、匪湘南縱隊共1.45萬人，爭取了偽新8軍近萬人投誠，生俘軍統東南辦事處主任王春暉、少將副主任張葆琛、匪交警2旅旅長李穰、匪湘南縱隊司令謝聲溢、匪救國軍第12軍軍長陳平裘及湘西巨匪陳光亭、賀幼龍等多名“大賊頭”，僅用20天就勝利完成原定1個月的剿匪任務，繳獲各型火炮17門、擲彈筒73副、火箭筒20副、輕重機槍172挺、衝鋒槍1040支、卡賓槍1069支、長短槍6645支及大批軍用物資。至此，湘南500人以上股匪被肅清。
與此同時，我軍在湘西實施的剿匪行動也取得重大戰果。湘西位於川、黔、鄂、桂4省交界地帶，山高林密，包括22個縣，各族居民約300萬人，歷來為匪盜嘯聚橫行之所，解放初湘西土匪竟多達230餘股。從1949年10月中旬開始，我軍不辭勞苦，奔襲追擊，予匪以重大打擊。1950年1月14日，我軍公佈湘西50天剿匪成績——消滅土匪1.04萬人，繳獲各型火炮18門、輕重機槍291挺、各種長短槍11757支，湘西阮陵、懷化、芷江、黔陽、辰谿、漵浦、永順、大庸等新解放區社會秩序大部安定。
特別值得一提的是1949年12月25日，禍害湖南人民近30年的大土匪頭子陳光被正法。陳匪是邵陽人，25歲起就開始幹殺人越貨的勾當，在湘、贛、貴一帶屠殺民眾數以萬計。1927年陳匪投靠蔣政權，屢次製造慘案。因積極反共，陳匪短短3年就從營長升至中將師長。參加對湘贛蘇區“圍剿”時，陳匪竟要求部下起碼要殺死5個人並割下耳朵為憑。據統計，僅1927至1934年，陳匪就在湖南平江屠殺百姓1萬餘人，其中包括彭德懷元帥的堂兄弟。
陳匪不僅嗜血殘暴，而且荒淫無度，被其強逼霸佔來的“姨太太”就有10個，而被陳匪侮辱過的良家婦女則多達千人。湖南和平解放後，陳匪仍充任匪“人民反共救國軍第6總隊”司令，到處姦淫擄掠，殺害人民政府幹部及起義人士。為討還這筆血債，我軍於1949年11月27日出兵進剿，很快全殲匪眾，生擒陳匪。
消息傳出後，平江、瀏陽、醴陵、茶陵、攸縣、邵陽、芷江等縣及江西蓮花等地被害家屬與各界群眾，紛紛推選代表到邵陽軍管會控訴陳匪罪行。12月25日在公審大會上，各界群眾3萬餘人到會，當陳匪被押到審判臺前時，全場暴雷似的響起“槍斃他！”“償還血債！”的怒吼聲。由於罪狀太多，公審大會整整開了4個小時，最後將這個殺人魔王當場正法。
截至1950年5月，我軍累計殲匪6.8萬餘人，湖南全境除少數偏遠地帶尚有小股殘匪流竄外，廣大地區已無匪蹤。而殘匪在我軍聲威震懾下，雖化整為零並依託幫會封建勢力繼續作亂，但覺悟日漸提高的各地群眾不再懼怕他們，反而積極協助我軍搜剿流散殘匪。沅陵縣一個農民領著部隊追捕匪首李榮厚，一連9天翻了16座大山，走了600裡，直到把李匪捉住才回家。許多土匪家屬也大義滅親，在麻陽縣魚肉鄉里十幾年的慣匪劉麻子，就是他叔父主動領著部隊去抓住的。
到1950年底，湖南全省已組建起40萬人左右的基幹民兵和防匪自衛隊，他們手持梭標、鳥槍日夜在山崗、要道口警戒盤查。匪“反共救國軍副司令”夏步雲坐船外逃時被當地民兵扣押，夏匪還想撒謊矇混過關，卻被同船群眾揭了老底：“別裝蒜啦，誰不知道你是大惡霸夏步雲。”據邵陽、長沙等12縣市不完全統計，當地民兵先後參加剿匪戰鬥200餘次，俘獲匪首32名、匪眾2350名，繳獲長短槍500餘支。
還是在1950年底，我軍湘西邊界剿匪取得決定性勝利，從當年10月16日至11月20日，35天就殲匪12721名，繳獲長短槍7300餘支、子彈16萬餘發，湘西最惡名昭彰的10餘名大匪首基本上被“一勺燴”，其中包括從臺灣派來湘西的匪中將、少將3人。湘西中心地區與邊界地帶已經連成一片，川湘、榆（榆樹灣）寶（寶慶）、安（安江）靖（靖縣）等公路暢通無阻。
不過，湘西剿匪並未就此結束。由於地勢複雜、地形不熟，剿匪過程仍異常艱難。我軍先後執行清剿作戰數百次，付出了千餘名官兵和大批當地群眾流血犧牲的代價，才於1952年末徹底肅清百年匪患。
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