如果人類為了水源和生存開始毀滅腳下的土地，那麼他們離滅亡也不遠了。
——記錄者
在寂靜的黑暗宇宙中，有一條保護所有智慧文明的法則，它被無數的智慧種族稱為“母星薄膜”。即星系外文明永遠不能尋找到智慧生命還未踏出的原始星系，除非這個星系的生命主動踏入到星系之外，打破保護這個星系的宇宙薄膜。宇宙會保護原始的生命星球，這就是存在於璀璨星空的原始法則。
每一類智慧文明都誕生於一個特殊的小星系，這個星系一般由十多個行星組成，具備誕生生命的一切條件，但不管生命的種類有多少，都只能誕生一種智慧文明，這就是宇宙優勝劣汰、適者生存的定律，被稱為“唯一法則”。
雖然這樣的星系在無邊的宇宙中不計其數，但原始的智慧種族不斷成長，總有一天會踏入到這個星系之外，開始遨遊漫無邊際的燦爛星空。隨著他們不斷探索宇宙中的奧秘，便會遇到來自不同星系的其他文明，戰爭成為雙方相互溝通的強力手段，直到雙方意識到他們處於同一個文明層級中，否則肯定是一方毀滅，或者成為奴隸才會讓這場文明戰爭停止。
星際歷298年，亞光速飛船“生命之光”號飛抵太陽邊緣奧爾特雲，這是一艘滿載5000人的科考船，包括3000名人類與智能機器人混編士兵和1500名來自各領域的傑出人才，以及以人類艦長以撒和副艦長智能生命大衛為首的500名艦隊隊員。
“生命之光”宇宙飛船承擔的使命是收集太陽系外的星球信息以及尋找適宜改造居住的生命星球。艦長以撒和副艦長大衛來自橄欖枝組織，這是一艘由橄欖枝牽頭打造的龐大艦隊，被組織創建人抱許了極大的期望，以期在遠離太陽系以外的地方，為人類和智能生命尋找到和平共處的安全之地。
星際戰國時代，人類一方在以天網為首的智能生命的攻勢下處於絕對的下風，在地球，他們果斷地開啟了兩次毀滅世界的核武戰爭，這兩次戰爭使得超過30億人死亡，後續帶來的環境改造還將影響更多的人類生存。雖然天網的智能生命在他們的打擊下也有所損傷，但從根本上來說，對局勢毫無幫助。智能機器人在遺留的核武器殘坑裡建造了新的工廠，核武遺留的輻射環境對智能生命來說沒有半分威脅，但對人類來說就是死亡的禁區。人類在地球取不到優勢，慢慢把重心向著地球外轉移，以至於殖民星的局勢由混亂向戰亂轉變，加重了星際戰國時代的慘烈程度。
維持僅有的和平的木星守護者橄欖枝組織在兩方的拉扯與威脅中搖搖欲墜，不得不建立了人類與智能生命的聯合軍隊，並在木星軌道佈置了防禦系統，禁止任何沒有經過允許的人類和智能生命飛船進入木星。
三足鼎立的時代正式來臨，以天網為首的智能生命在地球佔據絕對的優勢，人類一方在殖民地火星建立了永久基地，智能生命與人類的聯合組織橄欖枝則以木星為大本營，吸收幫助各處的難民，其餘大大小小的勢力則分別在在三個星球上夾雜生存。直到橄欖枝外派探索的“生命之光”艦隊從太陽系邊緣的奧爾特雲傳回信息，複雜局勢立刻改變了……
星際歷438年，“工程師”艦隊在海王星邊緣軌道發現了自遠方漂流歸來的“生命之光”逃生艙，逃生艙的電腦上用代碼寫著“我們不是唯一”的話語，搜尋人員在冷凍室發現了一具人類屍體和一個智能機器人的殘存大腦，人類是一名生物學家，智能生命是“生命之光”的副艦長大衛。“工程師”艦隊立即將情況上報給了橄欖枝組織，組織創建人唐拜託光皇提取了保留在機器人大腦中的殘留代碼，與此同時，天文學家發現包圍在太陽系邊緣的奧爾特雲有移動的現象，大約500年的時間就能從改變的奧爾特雲中觀察到太陽系以外的場景。
大衛的大腦中殘留的代碼不多，不過有一個詞在後期被反覆提及，那就是“母星薄膜”，再聯繫到突然之間開始移動的奧爾特雲，光皇的心中充滿了恐懼，黑暗虛空開啟了……
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