始皇帝的生父究竟是誰呢？歷史至少是公認這一點的，秦始皇的生母是“趙姬”，但這個女性的身份很特別，她先是呂不韋的愛姬，後又嫁給了當時在趙國作為人質的子異，之後才有了趙政的誕生。趙姬的特殊身份成為人們懷疑始皇生父的最主要原因。而在書中對他出生的記載也很少。從宋代開始便有人對始皇的生父有了兩種不同的猜測。
首先，在《史記·秦始皇本紀》的記載中有這樣一段，“秦始皇帝者，秦莊襄王子也。莊襄王為秦質子於趙，見呂不韋姬，悅而取之，生始皇。以秦昭王四十八年正月生於邯鄲”。莊襄王即異人。這段簡潔的記載其實已經將秦始皇的身世交代得很清楚了。從中可以看出他是異人和趙姬所生的兒子，司馬遷並沒有對他的出生有所質疑。
但在《史記·呂不韋列傳》中又出現了另一種相矛盾的記載，司馬遷在這一段中記載：“呂不韋取邯鄲諸姬絕好善舞者與居，知有身。子楚從不韋飲，見而說之，因起為壽，請之。呂不韋怒，念業已破家為子楚，欲以釣奇，乃遂獻其姬。姬自匿有身，至大期時，生子政。子楚遂立姬為夫人。”子楚，即異人歸秦國後改名為“子楚”。根據這段記載可以知道，秦始皇的母親趙姬本是呂不韋的情人，她與呂不韋同居有身孕以後，才由呂不韋送給異人，成為異人的夫人。趙姬隱匿身孕嫁給異人以後，“至大期時”生下的兒子取名為“嬴政”，這便是秦始皇，也就是說司馬遷在這裡又將他說成是呂不韋的兒子。
真實的情況究竟是怎樣的呢？為何《史記》中會有兩段不同的記載呢？史料上對於秦始皇出生到他21歲登基這段時間的記載是殘缺的，沒有人知道當中到底發生了什麼重大事情，也沒有人可以憑藉殘缺的史料推斷出歷史的真相，也沒有人知道秦莊襄王是否懷疑過這個“兒子”的真實性，但最後我們能看到的是，嬴政以太子的身份登上了王位，並在21歲開始親政。
對於《史記》的不同記載有相關專家認為，這純屬司馬遷在處理資料時出現的失誤。司馬遷一個人寫了3000多年的歷史，在這當中還有無數次的修改、增減和再編，隨著收集的資料增加，出現這種失誤是難免的。畢竟歷史存在很多不確定因素，而《史記》更注重的是事件的整體性，在細節上不可能做到面面俱到。始皇帝的生父究竟是誰呢？給歷史留下了無數的謎團，吸引著眾多的學者和探險家前來解密。
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