藍藻的危害
藍藻可以改變膨壓，在高溫強光照的天氣，它會聚集在水體表層吸收大部分陽光，大量繁殖並抑制其它藻類生長。同時，在繁殖過程中，藍藻會不斷地向水體分泌有毒代謝物質，影響浮游生物的種群演替、繁殖週期，還會引起一些浮游動物的大量死亡。
藍藻顆粒很難被魚、蝦類消化。藍藻通過種間競爭大量繁殖，逐漸成為絕對優勢種群，但隨後而來的種內鬥爭又會使其自身大面積死亡，導致水體生產力銳減，溶氧供應嚴重不足。同時，藍藻死亡分解也會消耗大量的溶氧，釋放大量羥胺、硫化氫等有毒物質。在嚴重缺氧和有毒物質存在的條件下，魚蝦生存困難，大量死亡。
如何降低甚至消滅藍藻的危害？
1、物理方法
（1）徹底清塘消毒、加註不帶藍藻的新鮮水
由於藍藻比其它藻類更具競爭力，因此控制措施以預防為主、防重於治。徹底清塘消毒可有效殺滅藍藻，降低藻種數量，避免大規模爆發。避免隨加水帶入藍藻，對控制也有積極意義。
（2）定期更換新鮮水
對於含有較多藍藻的池塘，經常、大量地換新鮮水，可稀釋藍藻的濃度，同時也可稀釋藍藻分泌的藻藍素等有毒物質的濃度，促進其它藻類的生長，保持整個生態系統的動態平衡。
（3）人工撈除
對於面積不大的養殖池塘，人工撈除是個有效的處理措施。具體措施是：用一根竹竿或者塑料管將藍藻圍到一個小角落，然後用密網將藍藻撈除，降低藍藻老化後對水體帶來的危害。
2、化學方法
（1）銅製劑
藍藻比其它藻類對銅離子更敏感，因此銅製劑常用作抑藻、殺藻劑。傳統使用的銅製劑是晶體CuSO4。CuSO4的藥效持續時間短，且易受水質鹼度及水中可溶性有機物、腐殖質及藻類自身釋放的多肽等因素影響，故使用時需連續施加。但高濃度的銅離子會引發浮游植物大量死亡，使水體嚴重缺氧。過多過量銅製劑的使用還會引起對蝦蓄積性中毒，造成其肝、腎組織損害，影響生長；同時，過多過量銅製劑的使用還會腐蝕蝦的鰓絲，形成黑鰓等疾病。因此，CuSO4不能經常使用，使用時需嚴格控制濃度。要注意在傍晚使用硫酸銅，迎下風口潑灑，使用時需停止增氧機，使硫酸銅停留在表面，增加表層濃度，從而有效殺滅藍藻。
為減輕銅離子對水生動物的影響，銅離子需製成銅基化合物，一般是用銅與三乙醇胺製作。其作用原理是銅離子從銅基化合物中緩慢釋放到水體中並維持一段時間的濃度作用，從而抑制藍藻的生長和大量繁殖，目前市場上已有絡合銅成品出售。
(2)茶麩
在藍藻爆發初期，茶麩作為一種藍藻抑制劑更多的應用是在對蝦養殖的水體中，因為茶麩含有茶皂素，對以血紅蛋白為氧載體的水產動物毒害較大，而對以血藍蛋白為氧載體的對蝦影響不大，因此只要控制好用量，便可起到抑制藍藻生長的作用，同時對對蝦也不會產生毒害。
(3)選擇性施肥
低氮磷比，有利於藍藻進行固氮作用，高氮磷比則有利於綠藻繁殖。國外一些學者認為，氮磷比接近或等於16:1時，能有效控制固氮藍藻的爆發。同時，我們的技術服務人員也在工作實踐中發現，在殺完藍藻後，少量多次的補充磷肥也可減少藍藻爆發。
3、生物方法
（1）放養一定數量的濾食性魚類。
雖然藍藻不易被消化，但由於其顆粒較大，更容易被濾食性魚類攝食到體內，因此放養一定數量的濾食性魚類有助於延緩、阻礙藍藻的生長。可供選擇的魚類有白鰱、花鰱、白鯽等。實踐表明，尾重200g以上的白鰱對藍藻具有明顯的抑制作用，當白鰱總量達到100Kg/畝時，藍藻基本不會爆發。
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