新式光電鼠標：新式光電鼠標利用很強的紅外線照射所在的物體表面，並每隔一定的時間做一次快照，然後分析處理兩次圖片的特性，來判斷座標的移動方向及位置（座標值）。它的工作原理像人的眼睛。它不需要特殊的鼠標墊，不用經常對鼠標進行清理，而且可以在幾乎任何物體表面上正常工作。
由於需要對圖片進行掃描才能確定鼠標的位移，因此掃描的頻率就成為衡量光電鼠標的一項重要參數。一般情況下，每秒1500次的掃描頻率是最基本的，有的產品其掃描頻率達到了每秒6000次。鼠標的分辨率是用每平方英寸的測量次數來表示（Dots Per Inch，DPI）。一般的光電鼠標大多都是400 DPI左右。
筆記本電腦鼠標：跟蹤球（Trackball）。跟蹤球實際上是一個倒過來的光機鼠標，工作原理也是類似的。可直接用手撥動軌跡球來操作電腦，控制光標移動。軌跡球的球座固定，在鍵盤的中央或邊上。
此外，因空間有限，常採用軌跡球的原理在鍵盤當中放置觸摸屏或壓力杆替代鼠標。
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