6-10月是龜苗出殼的高峰期。剛孵出的小龜苗體重6~15克，卵黃囊基本吸收完畢。
龜苗剛出生時非常好動，會在孵化盆裡四處爬動。當龜苗越來越多時，會疊在一起。如果盆裡沒有東西遮蓋，龜苗很容易爬出。在孵化後期要用塑料泡沫蓋住盆，但注意一定不能密封，要留細縫提供足夠的氧氣。龜苗出生後就要開始採集的工作了。
龜苗出殼後即可採集。將採集到的龜苗放進光滑的木盆、塑料盆內。每天早上進孵化室轉移龜苗前要檢查門縫及孵化室地上及角落是否有龜苗餘留，晚上離開孵化室前也要檢查一遍，並關好門。
收集後的龜苗要進行分類飼養
1）沒有收臍的龜苗
沒有收臍是指龜苗的卵黃囊在出殼時沒有完全吸收，還留有一部分卵黃囊在腹部。沒有收臍的龜苗要放到乾淨細沙的盆中幹養，直到龜苗的臍帶幹脫收斂，卵黃囊全部吸收為止。盆中的沙要細，防止卵黃囊擦破而被細菌感染。
2）完全收臍的龜苗
完全收臍的龜苗也要按照它的身體狀況進行分類，將畸形的苗與正常龜苗分別放在不同的麵包盆裡餵養。發育不完全會產生畸形苗，如短尾、缺眼睛，龜甲不全等。這些龜苗都要挑選出來與正常的龜苗分開飼養。
完全收臍的龜苗（包括畸形苗）收集分類完畢後，就可用清水進行飼養，水位以剛剛過龜背為宜。注意不能用高錳酸鉀溶液來浸泡龜苗，高錳酸鉀鹼性較強，會灼傷龜苗的皮膚，造成龜苗死亡。
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