先來看一下故事的劇情
第二部承接第一部的劇情，夜神月已經能熟練的掌握死亡筆記，並且已經殺害了自己的女朋友詩織和前來調查的聯邦探員，然後獲得了警部的信任，成功混進警部。L也已經開始懷疑夜神月就是基拉，並且堅信不疑，雖然詩織的死獲得了警部大部分人的信任，可是L仍然相信這都是夜神月的計劃。
電影的一開始呢，就是彌海砂撿到了另一本死亡筆記，遇到了它的死神雷姆（不是那個丟你雷姆）。彌海砂長相甜美是一個出道的偶像，而因為基拉制裁了殺害她父母的壞人，所以非常的崇拜基拉。死神雷姆告訴彌海砂，這本死亡筆記，寫上誰的名字誰就會死。
夜神月終於獲得了警部的信任來到L的秘密基地跟他們一起追查基拉，可是L根本不相信夜神月，直接就說出自己仍然還在懷疑夜神月。警部所有的人都被夜神月精湛的演技所欺騙，紛紛表示自己相信夜神月，並且認為L實在是太不近人情了非常的過分。夜神月的死神琉克不斷的勾引夜神月，讓夜神月用自己一半的壽命來換取死神之眼（死神之眼可以看穿人的真實姓名，這樣夜神月就可以知道L 的名字從而殺掉L）。而夜神月直接無視了琉克的建議，對L說自己一定會洗清身上的嫌疑幫助他們抓到基拉。
而此時呢，在群眾裡已經有不少人認同基拉殺掉壞人的做法，都覺得“警察都殺不了的壞人，法律都懲治不了的罪犯，基拉能正義的殺掉壞人，基拉一定是神吧”
在櫻花電視臺的廣場上，雖然正在舉行櫻花電視臺的慶典，可是人卻不是很多。而夜神月的妹妹跟她的好朋友也來到了這個慶典，二人一直感嘆居然沒有多少人。在櫻花電視臺的內部，高田清美是一個二號女主播，可是一直都想成為電視臺的一號女主播，而一號女主播伢子呢，是通過跟臺裡的小領導曾川根上床得來的一號位置。高田清美一直都很贊同基拉的行為，而且不斷的做關於基拉的電視報道。可是在櫻花電視臺舉行慶典的這一天，電視臺收到了兩盒錄音帶說是關於基拉的。曾川根當即決定瞞著上頭私自播放，高田清美跟他爭辯認為應該由自己來播報，可是曾川根非常的蔑視她直接把播報權給了伢子。櫻花電視臺為了收視率，把錄音帶放了出來，一時間廣場上擠滿了人都在看這個錄音帶。
錄音帶上的電腦合成聲音自稱第二基拉，並且聲稱基拉是絕對正義的，又在電視直播中殺死了一個反對基拉的座談嘉賓。一時間，廣場上的人都沸騰了，紛紛決定支持基拉的正義，警察趕緊出動維護秩序。此時L的秘密基地裡，警部的人也都看到了這一幕，L神情複雜的看向夜神月，夜神月呢看著電視上的第二基拉眼神有一絲絲疑惑，但很快的就恢復了面無表情。
夜神月趕到了現場去找自己的妹妹，正好被擁有死神之眼的彌海砂看到。彌海砂通過網絡查到了夜神月的家裡，然後找到了夜神月去了他家裡。然後彌海砂表示自己是夜神月的終極小迷妹，夜神月懲罰了害死自己父母的兇手，自己願意為夜神月做任何事，哪怕是去死都可以。夜神月也知道了彌海砂擁有死神之眼，就想到利用彌海砂去知道L的真實名字，然後殺死L 。夜神月利用彌海砂對自己近乎瘋狂的愛，同意了她做自己的女朋友。
第二天夜神月去上課，L跟蹤了過來。來學校看望夜神月的彌海砂正好碰到L，發動死神之眼得知L的真實名字之後三個人就分開了。夜神月迫不及待的給彌海砂打電話，接電話的確實L。L問到底是為什麼剛一分開就要給女朋友打電話？L說經過調查，彌海砂的家裡有寄到錄像帶信封上相同的衣服粉末，並且她是基拉的狂熱信徒，就把彌海砂抓了起來，要進行詢問，這段時間夜神月不能進審問室。
而彌海砂就真的好像失去記憶一樣完全不記得死亡筆記這回事，只記得自己深愛著夜神月。此時彌海砂的死神雷姆找到了夜神月，夜神月把自己的死亡筆記埋到了樹林裡。之後叮囑雷姆把彌海砂的死亡筆記交給另一個有野心的人。原來，夜神月打算跟彌海砂先暫時放棄死亡筆記，同時讓彌海砂的死亡筆記被別的人利用好繼續殺人。這樣子L就不會再懷疑他們，而憑藉著自己的智商一定可以找到彌海砂的死亡筆記被哪個人獲得，自己一定會再次恢復記憶（設定：放棄死亡筆記將失去跟死亡筆記有關的所有記憶），然後讓彌海砂去在樹林裡挖出來自己的死亡筆記從而殺掉L。
之後，雷姆把死亡筆記給了高田清美，高田清美則利用這死亡筆記繼續殺人（殺死了一號主播順利上位），然後自己持續報道基拉的案件。此時，失憶的夜神月通過自己的智商推理出最近基拉殺的人都是被櫻花電視臺報道最多的，而通過對比又知道了一號主播剛出意外身亡，二號主播高田清美上位。在她家裡安裝了攝像頭之後，成功獲得她用死亡筆記的證據，而且推算出來她寫到筆記上的人馬上就會死的事實。
逮捕高田清美的時候，夜神月再次摸到了彌海砂的死亡筆記，然後恢復記憶。用之前自己藏起來的一小片死亡筆記的紙片，蘸上自己手指頭上刺破的鮮血殺掉了高田清美。夜神月找到彌海砂讓她出去在樹林裡挖出來自己的筆記寫上L的名字然後殺死她，彌海砂也很聽話的照做了（笨笨的彌海砂忘記了L的名字，怕夜神月責怪她就又用一半壽命換了死神之眼）。
夜神月的父親跟警部的人要去把死亡筆記交給美國的警方，這時候L的秘密基地裡就只剩下夜神月跟L兩個人。L告訴夜神月，自己懷疑有兩本死亡筆記，彌海砂手裡必定還有一本。而她在監禁期間忘記了自己的名字，所以現在把彌海砂找來了秘密基地，如果自己死了，那彌海砂一定有一本死亡筆記。此時雷姆看到彌海砂的壽命正在逐漸減少，也就是說只要彌海砂來到基地就一定會死。雷姆為了延長彌海砂的壽命，殺死了押解人員，然後自己也死去了（死神如果延長人類壽命一定會死去，夜神月從一開始就打算讓雷姆去死）。與此同時，早就被寫上名字的L也痛苦的倒地死去，L死了了。現在沒有人證明彌海砂是基拉了，計劃通！
而為了銷燬證據，夜神月在彌海砂帶來的死亡筆記上寫了自己爸爸的名字。此時的夜神月爸爸帶著箱子又回到了秘密基地，夜神月對爸爸坦白了一切，希望爸爸明白自己要建立新世界的願望。而夜神月的爸爸表示，你不要再裝了，我在監控裡看到了一切。L也並沒有死，原來L的計劃是把自己的名字早早的寫道筆記上，寫上23天后死，所以，現在是死不了的（一旦寫上無法更改的設定）。而彌海砂的那本死亡筆記是假的，真的在L 的手裡。
最後夜神月瘋狂的要求琉克寫上所有人的名字，琉克表示自己玩夠了，寫上了夜神月的名字。
電影結束。
盤點一下主要人物吧
死亡筆記呢裡面充斥著高智商的對決，各種出乎意料的手法。看過的人都知道夜神月那個著名的計劃通的表情包，在原著裡夜神月是個高智商天才少年，最後殺死了L跟L的繼承者N，之後再被L的繼承M殺死。夜神月智商很高，執行能力超強，並且心思縝密，為了自己的目標可以犧牲任何人。
在一開始，夜神月只要殺死罪犯從而建立起完美的無犯罪世界，並且成功的讓世界犯罪率降低了70%。後來警察開始追捕這個自稱基拉的人，夜神月為了不讓他們阻礙自己建立完美世界的計劃就殺死了所有追查自己的警察。在警察開始偷偷調查自己的時候，夜神月通過自己房門上放的紙，明白了自己的房間有人進來過。最後夜神月逐漸的沉迷於自己的力量之強大，開始逐漸的專制獨裁。
彌海砂呢，很漂亮，也很可惜。彌海砂對於夜神月的近乎瘋狂的愛戀，使得彌海砂心甘情願被夜神月利用，她知道夜神月不愛自己，只是在利用她。可是彌海砂認為“只是被月利用也沒關係，月覺得沒有利用價值了殺了我也無所謂”。因為月不需要縮減壽命，所以彌海砂可以再一次的為了夜神月去縮短自己的壽命只是因為“如果忘記L的名字的話，月會怪我的”。在L 對她慘無人道的監禁中，整整三天沒有說過一句關於月的任何秘密，三天後，剛一開口就是“殺了我”。她並不理解夜神月的理想，她也不理解那種正義，她只是想讓月需要自己。在某種方面看來她跟我妻由乃有一絲絲像，一樣的病嬌。
在夜神月死後的情人節，彌海砂選擇結束了自己的生命。
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