非洲的研究人員一直在進行尖端的疫苗研究，一些關鍵認識可以被轉化為有效的疫苗或其他新型的干預措施，以防止HIV傳播，或達到功能性治癒。
關鍵的免疫系統
人們一直在研究人體控制HIV的機制，尤其在感染的早期階段。在HIV感染後的最初幾周，幾乎所有人都會通過殺傷性T淋巴細胞（CTL）CD8 +產生非常強烈的免疫反應，使人體能夠抑制部分HIV複製。
但是，大多數人的免疫系統對於HIV感染的易變區域卻沒有作出免疫攻擊。這使得HIV很容易產生變異以逃避免疫識別。此外，人體在感染急性期產生的CD8 +T細胞也是高度缺陷的。它們容易變得筋疲力盡，容易死亡，從而使HIV有機會持續存在。
HIV逃逸或適應免疫系統
HIV通過不斷突變來逃脫人體的免疫反應，同時不斷複製繁殖。雖然這是常見的現象，但在某些情況下，HIV易受攻擊的區域，如果正好是免疫系統的目標，仍然會被擊垮癱瘓。所以，如果HIV疫苗中包含這些病毒易受攻擊的區域，人體就會對這些區域產生免疫應答，使HIV癱瘓。這可能是一種有效的方法，甚至實現自然控制。
但，這不是故事的結局。還有一個複雜因素，那就是病毒真的非常狡猾，它們可以適應免疫系統的攻擊，逐漸產生新的突變，恢復其有效的複製能力。但科學家認為仍有可能阻止或限制這種現象。病毒脆弱區域可能成為阻止其複製的疫苗研製的良好選擇。
遺傳或病毒因素
在整個HIV疾病進展過程中有很多可變因素。
沒有抗逆轉錄病毒療法幫助之下，絕大多數感染者在10年內就會發展成為艾滋病。但有些人在兩年內發病甚至進展得更快。還有一小部分感染者，已經確診感染HIV有20多年，沒有服藥卻一直獲得病載抑制，也沒有發展成艾滋病，這些人又被稱為精英控制者。
研究表明，疾病進展的可變性可以由支配免疫反應的遺傳因子的差異來解釋。
有些人天生就具備了更優異控制感染的基因，使得他們發展出一個非常好的免疫系統，可以抵抗並控制病毒。這對於疫苗的潛在發展非常有用。
病毒的遺傳因素
艾滋病流行的一個重要特徵是，世界各地都有不同的基因型菌株（稱為亞型或分支）。不同的HIV亞型在生物活性方面存在差異，這些差異與所報道的疾病進展速率的差異是一致的。例如，在HIV的Gag區域，亞型B和D就比亞型A和C具有更高效的複製能力，這可以解釋為什麼一些基於人群的研究發現，感染HIV亞型B和D的人比感染亞型A和D的人具有更快的疾病進展。
矛盾的是，複製能力較低的亞型如A和C在感染更多人方面似乎更為成功，可能是因為攜帶病毒的感染者活得更久。
這項研究工作有助於解釋HIV如何影響個體的疾病進展速度，以及在一段時間內的流行和變化。這種知識對於預測流行病的蔓延以及如何防治疾病爆發是非常重要的。
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