一介布衣14
不知道你此處的“三非院校”是不是指非985、非211、非一流學科建設高校？暫時先按照這個定義來理解了。
從表面上看，很多考生和家長糾結院校和專業的問題，是覺得如果上了好學校，而專業卻不喜歡，擔心在大學四年的學習過程中自己痛苦，並且將來就業時不理想，該怎麼辦？或者為了學一個好專業，掌握熱門技能，只能將學校檔次降一格 ，選一個二流院校，最終卻發現畢業時名校文憑才是就業的“敲門磚”，又該怎麼辦？
貌似兩頭都糾結！
其實你這個問題，想明白了就簡單。首先，要看你的高考分數在哪個段位，如果屬於高分考生，能上名校卻非要為了某個二流院校的王牌專業而犧牲，那純粹是沒想開。如果是一箇中低分段考生，你的成績所能夠得著的最好的學校也好不到哪去，即好學校與差學校之間本身也沒甩開多大距離，那就不如奔著你喜歡的專業去努力了。
看你的提問，應該也有報考985高校的實力，那麼我建議你優先考慮985高校。
為什麼呢？因為既然你在這三個檔次的學校中，對比的都是同一個專業，說明你的目標很明確，就想在這個專業上發展。那麼就不存在專業不喜歡、不理想的問題。只需要考慮選擇不同院校的利弊就可以了。
當前，不管是考研、出國還是就業，對你本科院校的出身還是很重視的，985高校，也就是現在的“一流大學建設高校”，光環效應不可替代。說句不好聽的，如果你去找工作，又有幾個企業的HR會拿著教育部的學科評估表去對比，這個學校的該專業是B級，那個是A級？主要還是看你的學校名氣，只要聽到你的母校很牛，馬上就會對你高看一眼。
況且，你目前的想法，不見得十分成熟，如果你選擇985或者211高校，則未來的糾錯成本會相對低一些。你所在學校的整體氛圍（師資、學風、平臺）就是一筆巨大的財富，在潛移默化間對你的成長也能起到很大的助力作用。比如說你將來考研，可以選擇清華、北大、浙大、復旦這樣的頂級牛校，在這些院校中，你所學的專業全國排名再差也差不到哪去（本科時候考不上的清華、北大，考研的時候或許就能實現）。
退一萬步講，用一個能上985的分數，選一所你所說的“三非”院校，浪費的那些分數，你不覺得虧嗎？
所以，不用再糾結了，能上985還是選985吧，選不了985，再考慮211。至於專業等級評定，B級和A+之間，沒有你想象的那麼大的鴻溝。說不定過幾年專業排名又變了，只要不把它太當回事，它也就只是那麼一回事了。
高考同期聲
這個問題其實還是很有討論的意義。大概說說我的看法。
國家推進實施雙一流建設，其初衷其實就在於把高等教育的投入由對整個學校的支持變為對優勢學科的支持。從目前教育部對雙一流高校劃撥的建設資金來看，主體上也是按學科來撥的錢。也就是說同樣是985，同樣入選了雙一流大學，但如果入選的學科數不一樣的話，撥款額度也是不一樣的。因此，在高校圈子裡，隨後發佈的第四輪學科評估結果更具有參考價值，A+學科將成為未來大家關注的焦點。
這是從高校角度來看，從學生的角度來看，在大學和專業的選擇上，學科排名對報考碩士博士更有參考意義，但對高中生填報高考志願來說，學科排名所佔的權重並不大。為什麼這麼說呢？
第一，對大部分考研的人來說，研究生期間要接受的是學術訓練，而學科排名著重體現了這個學科的學術水平，那當然是要儘量考這個學科最強的高校；而對本科生來說，在大學裡接受最多的是常規教學、實踐實習、第二課堂、人文薰陶等等，這些東西基本沒有在學科評估中體現，所以，學科評估的好壞，對本科生來說遠不如學校的好壞。
第二，對考研考博的人來說，自己的專業已經學了好幾年了，大部分人是不會輕易換專業的，而且畢業後也是準備留在這個領域的，所以很多人更願意選擇A+學科。比如前面有答主說同一學科，在華中科大是A+，在清華是B，我認為考研考博一定要選前者，而不是後者。
而對高中生來說，他們的專業基礎完全是空白，也不大有職業概念，除非有人有興趣特別想學某個專業，大部分人對專業的概念僅限於理、工、文、管、醫這個層面。他們也並不是非要學某個專業。所以，在報考志願時，一定是優先選擇清華而不是華科，至於專業，考上哪個是哪個。
至於題主說的三非高校A+，也就是說學科是A+，但沒有入選雙一流學科，這樣的學校我不確定是否有，即便有，也絕對是個別。我個人認為，這三個學校排名，對高考來說，是1優於2，2遠優於3。對考研考博來說，1和2差不多，皆可，3還是次之。不是說三非高校A+不強，而是覺得性價比不夠高。要知道，如果學科評估能到A+，卻不能進雙一流學科，只能說明這個學科在國內還算不上數一數二，那報考的意義就不大了。
高校人才真經
先不說985與雙非比較，先想想，都是985大學，如果能考上清華大學的光學工程，你是讀清華大學還是華中科技大學？教育部17年學科評估，清華大學光學工程B+，華中科技大學A+
3個Z1
首先，工作之後很少有人看你的專業排名的，大部分都是看學校名氣的，如果只是為了就業，還是選擇名氣大點的，如果你想深造，搞學術，搞科研，建議你還是選擇專業性比較強的，這樣你接觸的資源比較多，導師比較專業，希望你有自己的選擇。
知教
一杯清茶
貌似很好的假設，也非常的有討論必要，看似就是選專業呢還是選名校。仔細想想，則不存在這樣的情況，即使有，我想說，還有更好的選擇。因為都已經明確了，同一專業，那我想說，就不要只拘泥你本地或者省會城市你瞭解的三所學校了，為什麼不去選擇985裡同樣錄取分數線但是專業評級為A或者A-的呢？
Laco72777431
這個看你是讀哪個階段，哪一個專業。如果是本科，報考文科專業，肯定報考文科專業性強的高校，再次考慮學校層次。如果是本科，理工科專業，肯定報考985學校，這樣後期發展的機會要大很多。如果是讀研究生，肯定要去行業類專業性強的高校。
