據醫生推測，腫瘤細胞最先可能是在閡尾附近生成的。沒有人能夠斷定這一點，因為腹腔鏡無法直接看到閡尾的位置，它躲在腹腔的角落裡，我們對這個人體內已經退化的無用的器官所知甚少，但是它卻殺死了赫本。
醫生估計大約五年前她就已經患上了結腸腫瘤，不過腫瘤細胞在她的體內繁殖得很慢，在發現的時候腫瘤並不大，然而壞消息是腫瘤細胞在她體內已經開始擴散，導致她經常感到腹部疼痛的原因是腫瘤壓迫了她的迴腸，使得這個起到吸收營養物質作用的器官受到太大的壓力而無法正常工作，不能夠讓食物通過從而導致痙攣。醫生切除了她的一部分盲腸，希望能夠減輕痛苦。
但是不久她的病情急轉直下，迅速惡化。在切除了盲腸和結腸之後，不到幾天時間，腫瘤又轉移到了胃部。赫本知道自己的病已經沒有治癒的希望了，於是決定放棄化療。家人當然不同意，赫本想起了1988年和好友約翰·艾薩克就死亡話題的討論，於是要他向自己的家人確認她曾經的願望。這實在很為難，約翰後來說，“因為我知道她的家人肯定希望她接受化療，但我卻只能說出事實，告訴他們她確實希望不要接受化療。”
想在家中過聖誕節。12月19日，赫本在做完最後一次手術後，希望回家並在瑞士過聖誕節。醫生警告說，飛機在起飛或降落時，機艙內的氣壓變化有可能使得她腸內的某個多重閉合破裂，從而導致腹膜炎。如果這樣，赫本1個小時內便會死於血毐症。但在赫本的要求下，家人還是帶她到了機場。還好，一路上人們擔心的事沒有發生。
赫本最信奉的就是愛。在臨終前3天的最後一次散步，園丁向她走來並說：“西格諾拉，等你身體好了，要來幫我整理花園啊，修剪樹枝，再種點新的花草。”赫本微笑著說：“吉奧瓦尼，我會幫助你的，但是不會像以前那樣了。”上樓梯的時候，她感覚很累，不過她又想起了她的小狗，擔心兒子的兩條大狗會吞掉她的小狗，並形容說“就像吞漢堡一樣”。
去世前為了躲避狗仔隊的追蹤而需要特別護送時，赫本的朋友紀梵希馬上把自己的私人飛機借給奧黛麗赫本使用。垂危中的赫本詢問紀梵希為何知道她需要這種幫助，紀梵希說：因為你是我生命中最重要的人。聽了此話，奧黛麗·赫本竟高興得像個孩子。她去世前的心態很輕鬆。
赫本一直都在強撐著。兒子曾經問她：你害怕嗎?她搖搖頭，說：“我真的很開心。因為這次我確信，我確信你們是愛我的。”但終於有一天，她說：“我很抱歉，但我已經準備好要走了。”1993年1月20日由於病情加重，赫本一直在沉睡，大家都知道赫本已經不行了，就請來了牧師。禱告儀式後不久，下午7時左右，赫本病逝於家中，享年63 歲。她長眠於離家不遠的一處寧靜的鄉村墓園，下葬時戴著丈夫羅伯特與兒子西恩送的兩枚戒指。
上帝都願意輕吻她的臉頰一一奧黛麗·赫本。
“一個人總是要死的，但我最依依不捨的不是自己的生命，而是第三世界那些被戰爭、乾旱和飢餓困擾的兒童。”奧黛麗·赫本，她像天使一樣美麗動人，內心純樸善良。她把美灑向人間，把慈愛獻給眾生。赫本氣質高雅、性格堅毅，她冰清玉潔、樸實無華，就像布魯塞爾一樣，集最古老的神秘和現代觀念於一身，她的舉止總帶有一種貴族氣派。
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