印度独立以来，印度和日本双边关系都很好，第三方因素是影响双边关系的主因。
在审判日本战犯的远东国际军事法庭，有一位印度法官，名叫Radhabinod Pal。他持同情日本的态度，一定程度上造成部分战犯被轻判。日本人直至今天仍非常感激Radhabinod Pal。
1949年，印度给东京动物园送去两头大象，庆祝日本获得新生。1951年，印度还拒绝参加旧金山和会，理由是印度认为旧金山和约将损害日本主权的完整。1952年，印度和日本签署了和平条约，从而正式建立邦交关系。在这个条约中，印度放弃了日本的战争赔偿。从此，印日关系迅速发展起来。
印度铁矿丰富，为日本钢铁产业输送了大量铁矿石。1957年，岸信介访问印度，一年后，日本开始为印度提供日元贷款援助。印度成为首批接受日本金融援助的国家。
但是，当时日本和印度的关系受到客观因素的限制。因为日本属于美国阵营，是美国的军事盟友。而印度事实上倾向苏联方面。这导致印日关系的潜力受到制约。
但是，20世纪80年代起，印度提出“向东看”政策，将日本作为重要合作对象。印日关系得以进一步改善。1986年起，日本成为印度最大的援助国。
1998年，印度核试验后，西方国家集体制裁印度，日本也参与其中。印日政治交流中断，日本停止了对印经济援助。三年后，制裁取消，印日关系迅速回暖。2014年，安倍访印期间还参加了印度“共和国阅兵”。当年，莫迪访问日本时，印日建立“特殊全球战略伙伴关系”（Special Strategic Global Partnership），比原来的“全球战略伙伴关系”更上一层楼。
2016年，莫迪第二次访问日本，印日签署“和平利用核能合作协议”，日本将向印度提供核原料和反应堆技术。在未签署《不扩散核武器条约》的国家中，印度是唯一获得这一“特殊待遇”的国家。
当前，美国正试图在各地区寻求代理人，而日本和印度分别是西太平洋和印度洋的理想合作伙伴。在美国的召集下，印日关系可能会进一步走近。
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