成吉思汗妻妾眾多，子女眾多。但是具有第一繼承權的只有正妻孛兒帖所生的四個兒子。
成吉思汗的大妃孛兒帖
朮赤，成吉思汗的長子，因出生前其母被蔑兒乞部落搶走。所以有人懷疑朮赤不是成吉思汗的親生兒子。然而朮赤勇猛傑出，功勳卓著，成吉思汗並沒有對他區別對待。成吉思汗西征之後，將朮赤分封於西北廣大地區，即欽察汗國後來成為龐大的金帳汗國。朮赤之子拔都，是蒙古部中僅次於成吉思汗的偉大英雄。朮赤至少有14個兒子，後代分別建立了白帳汗國、金帳汗國、藍帳汗國、克里米亞汗國、喀山汗國、哈薩克汗國。是蒙古帝國中僅次於本部之外最強大的支系。
蒙古帝國四大汗國
察合臺，成吉思汗的次子，與朮赤不合，支持窩闊臺繼承蒙古大汗，所以察合臺在窩闊臺時代地位崇高，被分封於西北地區，在朮赤汗國東南，大致區域是如今中亞與中國新疆地區。成吉思汗的四個嫡子在汗位爭奪中分為兩個派系：長子朮赤與四子拖雷、次子察合臺與三子窩闊臺。窩闊臺的兒子貴由汗去世後，朮赤的嗣子拔都支持拖雷的兒子蒙哥繼位，從此朮赤系諸汗與察合臺系開始敵對。察合臺汗國後來分裂為東、西察合臺汗國，察合臺汗國滅亡後，後代建立葉爾羌汗國，最後亡於清朝時準噶爾部的大汗噶爾丹。
窩闊臺大汗
窩闊臺，窩闊臺由於繼承了成吉思汗的大汗之位，所以成吉思汗沒有給他分封獨立的汗國，但是窩闊臺的兒子貴由汗去世後，大汗之位轉入拖雷系。窩闊臺的後裔海都在西北的巴爾喀什湖以東的地區建立窩闊臺汗國，反對拖雷系元朝皇帝的統治。窩闊臺後裔後來因參與察合臺汗國汗位的爭奪而被察合臺後裔趕出西北地區，窩闊臺汗國迅速滅亡。
拔都汗
伊爾汗國，旭烈兀是拖雷的的第五子。拖雷長子蒙哥在拔都的支持下奪取了蒙古大汗的汗位。他的三個弟弟都得到了重要，阿里不哥守住蒙古本部，忽必烈負責中國事務，旭烈兀西征波斯。蒙哥去世後，旭烈兀支持忽必烈繼承大汗之位，忽必烈將波斯地區封給旭烈兀建立汗國。這就是蒙古四大汗國之一的伊爾汗國。旭烈兀與欽察汗國諸汗中的別兒哥汗爭奪阿塞拜疆地區，後裔統治伊利汗國近一百年，被欽察汗國擊潰，最後亡於帖木兒帝國。
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