細胞STR鑑定有用嗎?發論文一定要做STR鑑定嗎?

 在過去的幾十年間,細胞生物學領域的文章一直在發表,科研成果一直在公佈,但是,當中哺乳動物細胞被錯誤鑑定、存在交叉汙染的情況也同時存在著。

  首先,想問大家一個問題:認錯了細胞系會造成什麼後果呢?

  稍微想一下,就知道後果很嚴重——

  1、浪費時間和科研經費;

  2、實驗結果不可重複、科研結果不可靠;

  3、會被學術期刊拒收或撤稿。

  據統計,目前有超過30%的細胞系被錯誤辨識或受到交叉感染。

  2010年《國際癌症雜誌》(IJC)統計出一列表,在346篇文章中,有103篇存在細胞被Hela細胞汙染的情況。

  最可怕的錯用是在瑞典某大學的一個研究組裡,該研究組從1988年起就錯誤的使用了Hela,以為是lnt-407細胞系,並因此在從1988到2011年裡發表了41篇論文,全部是錯的。這些文章發在Oncogen,JBC,Carcinogenesis,PLoS One, J Cell Physiol, Cancer Res, Br J Cancer, Biochem J, Exp Cell Res等眾多較好的雜誌上。


圖:Hela細胞

圖:Hela細胞

  除了著名的Hela細胞外,在2001年,科學家在一篇論文裡報道了一株新建立的大鼠視網膜神經節的細胞系,命名為RGC-5。在隨後的十幾年時間裡,至少230篇論文的研究與假設是建立在這株細胞繫上。結果在2009年,序列測定結果表明,RGC-5是一株小鼠(mouse)細胞。

  2017年,武漢大學病毒學國家重點實驗室發表了一篇文章,主題便是“278株常見人源腫瘤細胞系的交叉汙染及錯誤鑑定”,該實驗室採用STR分型方法進行細胞系遺傳背景鑑定,結果得到了一個可怕的結果。

  作者分別從國內28個研究機構蒐集了278株常見人源腫瘤細胞系,其中國內建立的細胞系71株,國外建立的細胞系207株。

  經STR鑑定後發現,來自於22個研究機構的128株細胞存在交叉汙染/錯誤鑑定的情況,錯誤率高達46%。其中國內建立的細胞系佔52株,

  這表明了什麼,國內建立的細胞系交叉汙染/錯誤鑑定率竟然高達73.2%,並且67.3%(35/52)國內交叉汙染/錯誤鑑定的細胞繫結果被證實是Hela細胞或被Hela細胞部分汙染的!

  據統計,128株錯誤細胞系中,其中交叉汙染細胞系佔84.8%(108/128),其餘為錯誤鑑定細胞系。從國內/國外來源細胞的情況統計結果看,Hela細胞的絕對“攪屎棍”地位不容撼動!

  所以,你需要“細胞身份證明”——細胞STR鑑定

  近年來,大量研究表明STR 基因分型方法是進行細胞交叉汙染和性質鑑定的最有效和準確的方法之一,STR 基因分型應用於細胞鑑定已被ATCC等機構強烈推薦,美國的ATCC細胞庫、德國的DSMZ細胞庫以及日本的JCRB細胞庫等為STR 分型提供了各細胞株的數據供對比。

  STR基因位點由長度為3~7個鹼基對的短串連重複序列組成,這些重複序列廣泛存在於人類基因組中,可作為高度多態性標記,被稱為細胞的DNA指紋,其可通過PCR(聚合酶鏈式反應)來檢測,STR基因座位上的等位基因可通過擴增區域內重複序列的拷貝數的不同來區分,在毛細管電泳分離之後可通過熒光檢測技術來識別,隨後通過一定的計算方法,即可根據所得的STR分型結果與專業的細胞STR數據庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能交叉汙染的細胞系名稱。

  何時需做細胞系鑑定?

  1. 發表文章或申請課題經費前;

  2. 使用細胞進行臨床治療(試驗)前;

  3. 準備凍存保種或已凍存多年的細胞;

  4. 一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時;

  5. 新得到的細胞或實驗室培養5代以上的細胞;

  6. 細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大;

  如何減少細胞系交叉汙染?

  1. 從信譽良好的組織或機構獲得細胞系

  2. 良好的文檔編制方法

  3. 訓練有素的技術操作員

  4. 每種細胞系單獨使用培養基

  5. 溶液或試劑分裝使用

  6. 常規性地注意細胞系身份以及其特性是否發生汙染

  7. 早期做好充足的凍存儲備

  8. 細胞培養代數不要太高


  有了細胞STR鑑定,你的細胞也是有“身份”的細胞啦!而且科研成果更可靠,也不用擔心發表科研文章時的細胞鑑定問題了,有沒有感覺很強大、很安心呢!


應廣大用戶的強烈要求,中國科學院生物化學與細胞生物學研究所蘇州研究院可提供快速、可靠的人源細胞STR鑑定服務,出具用於論文發表的中英文檢測報告。目前已為多家高校、科研院所和企業客戶提供了高效、高質量的技術服務,並獲得了良好的反響。