話說在軒轅沒選上主席之前就看到一個叫蚩尤的人不順眼了，蚩尤為什麼牛？兄弟多呀，據說有兄弟八十一人。有沒有那麼多兄弟目前已經無法考量，但歷史傳說是這樣的。除了兄弟多，蚩尤自身還孔武有力，好戰成性。從小到大跟別人幹仗沒有幹不贏的。所以誰當主席他都不服，誰當主席他跟誰對著幹，雖說跟原來神農主席家有淵源，但也不大賣神農主席的賬。現在你軒轅來當主席，兩家沒淵源，我服你個鳥啊。你憑什麼當主席啊？應該由兄弟多的來做。所以當軒轅派人拿著蓋著主席大印的命令送給蚩尤時，蚩尤就直接把它當手紙給擦屁股了。這還了得，於是軒轅黃帝找來了分到田地的熊、羆、狼、豹、貙、虎六大部落，還去前主席神農家徵詢了老同志意見；神農自然不敢有二話，主席說打咱就打，我一定不遺餘力支持主席。上下意見統一，軒轅黃帝召集大部隊，以熊、羆、狼、豹、貙、虎六大部落為主力先鋒向蚩尤老巢撲去。至於蚩尤老巢在哪裡，歷史沒有明說，有些說南方，有些說北方，既然雙方是在涿鹿遇上的，而軒轅黃帝勢力在現在河南鄭州一帶，蚩尤的老巢一定是在涿鹿以北地區。那蚩尤本來就想挑事，現在你打上門來，豈有不應戰的道理，於是也帶著八十一個弟兄來找軒轅爭奪主席位置了。
雙方在涿鹿（據說是現在的河北張家口涿鹿縣）這個地方遇見了，於是二話不說便開幹，這一仗可沒和阪泉郊外與神農主席撕逼那麼容易，對手太強大了，開始是熊、羆、狼、豹、貙、虎六大部落跟著軒轅一起打蚩尤，打得天昏地暗，一共打了九場大架，沒一場打贏的。後來再調雕、鶡、鷹、鳶四大部落前來助拳，經過不懈努力，加上老天保佑，原來迷霧重重的戰場突然雲開見日，把蚩尤部隊嚇得一大跳，全部暴露在了軒轅黃帝大軍面前，黃帝大軍掩殺過去，終於打贏了蚩尤兄弟們，將蚩尤捉拿歸案。據說黃帝和蚩尤先後大架小架加一起共打了五十二架，這蚩尤也太厲害了，軒轅黃帝可不敢留其活口，於是拍了照按了手印直接不經審判秘密給做掉了。為了彰顯自己的德行和展示自己的自信心，對外宣稱蚩尤已歸降本主席，本主席已經任命其為軍委副主席，專門替寡人征討天下逆賊。為什麼這樣做？雖然蚩尤是被殺了，但蚩尤部族很多人都逃往了南方，為了演得像一些，黃帝去征討蚩尤殘餘時都會把蚩尤在拘留所拍的照片貼在軍旗上，以證明這是蚩尤帶隊的軍隊，你們早點歸降吧。據說蚩尤部落被打敗後，大部分殘餘不敢在原來地盤久留，帶著妻兒老小全部往南往西遷徙，為了活命，全跑到西邊、南邊蠻荒之地去了。據說現在的苗族、瑤族、羌族等都是蚩尤族的後裔。
為什麼蚩尤那麼厲害呢？原來那時據說蚩尤部都用上了銅、鐵的兵器，而黃帝部隊還拿著用石片磨的石斧、石矛，這怎麼打？所以開始讓黃帝部隊吃了不少虧。後來據說是因為打下了冀州的蚩尤兵工廠，黃帝部隊才開始鳥槍換炮，最終打贏了蚩尤。
蚩尤弟兄多讓黃帝吃了大虧，要想自己的天下穩定，那就得兄弟多。所以“打架親兄弟，上陣父子兵”這說法便長久地在中國流傳下來。於是軒轅帥哥就邊征戰邊生孩子，據說原配嫘祖為其生下兩個著名的兒子，一個是玄囂，一個是昌意，黃帝死後，從少昊（玄囂）到明代四千多年，除了中途出現了一百年不到的蒙古元政權之外，幾乎都是玄囂、昌意兩兄弟的後裔掌控著中國政權。
在生孩子方面男性要比女性佔有優勢，這也是女性無法幹大事業的原因。女性生個孩子沒一年以上搞不定，而男性一夜可生一個。軒轅黃帝共生子二十五人（究竟是兒子，還是把女兒也計算在內，歷史有爭論），總之，生孩子跟下餃子似的，十分輕鬆。並給十四個兒子賜了姓。其中姬姓和酉姓分別賜給四個兒子，另外十個兒子分別被賜祁、己、滕、箴、任、荀、僖、姞、儇、依十姓。
黃帝的一生最大的特點應該就是征戰與播種，播種數量已經寫進歷史了，關於征戰，《史記》記載，只要有不順從的，黃帝就去討伐，平了一個地方就去討伐下一個不順從的部落。據說黃帝中早期是無固定都城的，黃帝打到哪裡，哪裡就是黨中央。然後所有軍隊都駐紮在黃帝大帳四周；官職都以“雲”來命名。還搞了左右大監，主要是監督天下各諸侯，看看大家是否老實聽話。黃帝時的疆域東到大海，南到湖南一帶，西到甘肅平涼一帶，北到河北北部。
黃帝大約從公元前2697年至公元前2599年在位，在位時間98年，加上他20歲繼承本部落諸侯王位，可推斷其出生時間是在公元前2717年，享年118歲。