1946年4月8日，秦邦憲和王若飛由重慶乘飛機返回延安。同機的還有在皖南事變中被國民黨囚禁的新四軍軍長葉挺將軍，他是經過政治協商議多次向國民黨交涉才被釋放的。與他同行的有他的夫人李秀文，11歲的女兒葉揚眉和三歲的幼子阿九。出席巴黎世界職工代表大會的解放區職工代表鄧發回到重慶，也搭機返回延安。隨機同往的還有王若飛的舅父，貴州省教育家黃齊生老先生及其孫子黃曉莊，還有十八集團軍參謀李少華等共13人。這架飛機由美軍駕駛員蘭奇上尉等四人負責飛行任務。
4月7日，重慶八路軍辦事處向延安發電：王若飛、秦邦憲、葉挺、鄧發同志於4月8日上午，由重慶乘飛機返回延安。當時任第十八集團軍總部秘書長楊尚昆立即向主席作了報告。主席聽了很高興，他非常想見到被釋放出來的葉挺將軍。楊尚昆著手組織有關人員到機場去迎接。
4月8日，飛機到達西安後，又一汾向延安發電說，飛機準時到達延安。時間是12時25分，其位置據情判斷，應在甘泉一帶。甘泉居民曾於蒙雨中聽到飛機聲。
8日下午1時，領導們陸續來勤機場，準備迎接王若飛、秦邦憲等人的到來。秦邦憲的夫人張越霞也帶著小兒子俠兒來到機場迎接親人。
天空陰雲密佈，雲霧矇曨。預示著不祥兆頭。不一會，下起濛濛細雨，在機場等待的人們，心裡十分焦急，這樣的陰雨天氣飛機能按時到達嗎？大約下午兩點左右，陰雨中傳來了飛機的隆隆聲。來了，飛機來了，大家翹首期待著巨鷹從天而降，準備迎接來自鬥爭前線的戰友和親人。飛機聲由遠而近，又由近而遠，漸漸聽不見了。機場上，人們在低聲議論，恐怕這樣的天氣飛機不能降落，又飛回西安去了吧。欣慰的笑容從人們的臉上消失了，緊接著是疑惑和不安。時間一分一分地過去，仍不見飛機的出現，大家有些失望，到下午4點鐘，人群慢慢地散去。
主席和朱總司令回到王家坪，在桃園路口慢慢地走著。兩人也在談論為什麼飛機不能按時到達延安，是不是有了什麼變故，但西安沒有來電報呀？氣候惡劣不能在延安降落，那麼西安的氣候又怎麼樣呢？飛機能降落嗎？油用盡又該怎麼辦？兩位領導人分析著各種可能產生的情況，心中越發地不安了，趕快向西安發電詢問情況。下午5時回來了電報：該機未曾返航。
到底發生了什麼情況？第二天零時過後，美軍觀察組忽然來電話說：C-47飛機失蹤了，既沒有到北平，也沒有回重慶。他們準備派兩架飛機來延安附近搜索。楊尚昆立即將這一消息向主席及其他領導作了彙報。大家預感到飛機可能失事，心情都十分沉重。原來，秦邦憲等人於4月8日上午乘坐的C-47美式運輸機，由重慶飛抵西安，加油後直飛延安。當抵達延安上空時，正值陰雨，滿天陰雲密佈，飛機穿雲飛行，幾十步外都看不清楚。當時飛機的導航設備比較差，只好返回西安。由於氣候惡劣，能見度很差，迷失了方向，誤向晉綏邊區飛去。進入了山區，為了尋找地面目標，飛行高度很低，於濃霧中觸山失事，同機17人全部遇難。
4月8日，飛機失事時，黑茶山附近村民曾聽到隆隆的飛機聲，緊接著是一聲劇烈的爆炸聲，住在黑茶山下莊上村白石窪的幾戶村民，迅速報告村裡的幹部。村長李文堂隨即帶領幹部黨員趕赴山上，發現了被摔毀的機身及遇難人員的屍體和遺物。他們搞不清眼前發生了什麼事情，失事的飛機是敵是友？當晚召開了黨支部委員會，初步決定第二天組織人員上山，將機上人員屍體抬下山就地掩埋。
會議開到快12時，區大隊長劉富和另外一名區幹部匆匆趕到，說明有一架載有黨的重要領導及高級將領的飛機失事，正在尋找。於是由區領導繼續主持會議，決定村公所支部書記王發友留村主持日常工作，民兵中隊長張根兒、農會主任康俊帶領50多名民工天一亮立即上山，趕赴出事地點，尋找烈士遺體，整理一切遺物。
據張根兒口述材料記載：50多人分成了17個小組，每組3人，對飛機及其周圍展開搜尋，還作出嚴格規定，任何一組找到烈士遺體，必須輕輕抬下山，絕不允許烈士遦體土遺體，必須輕輕抬下山，絕不允許烈士遺體受到任何損傷。搜尋工作持續了一天，從飛機殘骸中撿到了一張名單，上面有王若飛、秦邦憲、葉挺、鄧發等13人的名字，證實了遇難烈士的姓名。
他們上山同時，另派專人趕到中共晉綏分局報告。分局得訊後，一方面急速向中央報告，另一方面立即派保安處處長譚政文，及地委苗逢樹等人帶幹部戰士40餘人趕往出事地點。
4月10日早晨，譚政文等人趕到黑茶山腳下。從黑茶山腳下的村莊到出事地點大約有二三里地，大家懷著悲痛焦急的心情，沿著起伏的山路快速地行進著，一路上默默無語，只想早一點趕到現場。
在現場首先看到了飛機撞石處。飛機是撞在黑茶山南坡東側的一塊巨石的南面，撞石的印痕清晰可見，如果飛機略飛高一兩公尺，悲劇就可能不會發生。飛機的殘骸斜躺在一塊突出的巨石前20米的山坡上，飛機殘骸四周的樹木都已經被燒光，到處散落著的是已經燃燒過的木炭和黑灰，空氣中仍然殘留著強烈的汽油味。飛機的殘骸頭朝上，螺旋槳已經摔斷，周圍都是飛機機體的碎片。在飛機殘骸東西兩側較遠處，比較順利地找到了烈土們的遺體。
幹部和戰土面對這種悲慘的情景悽然淚下，脫下軍帽，肅立致哀。他們把烈士們的遺體抬到山下，用白酒洗去他們身上的泥土，換上了新衣。人們默黙地發誓：不管黑茶山多麼高，多麼寒，只要我們在，敬愛的同志們，你們安息吧！你們的遺志一定要實現！烈士們的遺體收斂後，停放在黑茶山下，莊上村南古廟（岱五廟）內。
烈士們所帶的文件大部已經被焚燬失散了，剩下的只有一些烤焦的紙片。在遺物中找到了秦邦憲和黃齊生的兩顆印章。
11日，晉綏軍區政治部派來裴周玉，他是鋤奸部的科長，來調查飛機失事的原因。經過大家認真分析，一致認為，當天氣候十分惡劣，能見度很差，飛機迷航飛越黑茶山時，撞山爆炸墜毀，並將這一分析情況向晉綏軍區作了彙報。
延安在得到飛機失事的報告已是4月11日晚10時了，不幸的消息使各位領導悲痛萬分。
4月12日清晨，晉綏分局負責人李井泉親自偕同邊區政府康世恩、新華社分社鬱文等一起前往料理後事。
4月12日《解放日報》發表了秦邦憲等同志遇難的消息，悲痛宣佈：王若飛、秦邦憲、鄧發、新四軍軍長葉挺等同志，在本月八日乘美機由重慶飛延安途中，因飛機迷失道路，於下午二時左右在晉西北興縣東南八十里黑茶山遇霧，撞山焚燬，當即全部遇難。當時在召開的陝甘寧邊區三屆一次參議會得到這一消息後，陝甘寧邊區政府主席林伯渠含淚向大會報告了秦邦憲等人殉難的經過，決定休會致哀。特派副議長安文欽、謝覺哉等10餘人代表全體參議員唁慰。通令全區下半旗三日，停止娛樂活動一個月，以示哀悼。
消息傳出後，整個延安籠罩在沉痛之中，不少人失聲痛哭，不少人默默流淚。主席三天沒有睡好覺。新市場十字街口的黑板報上，以顯著大字標題寫著“千萬人同聲哀悼”，詳細登載了秦邦憲、王若飛等人不幸遇難的噩耗。不少工人、農民、戰士、學生，在黑板報前佇立良久，然後又流著眼淚默默地離開。噩耗傳到清涼山，多少人失聲痛哭，多少人淚流滿面，他們萬萬也沒想到，自己昔日的領導和親密的戰友秦邦憲同志突然永遠離開了。人們怎能忘記，他以往的音容笑貌，他爽朗的笑聲，他那循循善誘的教導。清涼山沉浸在悲痛的氣氛中。
延安方面決定，等烈士靈柩接回延安後，舉行隆重的葬儀與追悼大會。山區交通十分不方便，最好的辦法是用飛機把烈士的靈柩儘快接回延安，而離黑茶山最近的機場嵐縣機場，也有150多里。
13日晨，秦邦憲等烈士的遺體暫時停放在莊上村的古廟裡。連日來，村裡前來弔祭的達幾千人。人們淚流滿面，有的婦女放聲大哭，氣氛悲痛。祭奠後，靈柩由康世恩護送起程。從莊上村到嵐縣機場的途中，老百姓爭先恐後為殉難烈士抬棺，充分表現了廣大純樸農民的深厚感情。
13日夜，到達回回山時，因山路太窄，兩人不能並行，幹部們用背扛著棺材爬著前進。當靈柩到達曾為日寇盤踞五年之久自赤尖嶺村時，村中群眾紛紛相告：敵人就是這些人想辦法幫咱們趕走的，是咱們的大恩人。抬棺者迅速集中起百餘人，互相叮囑要小心抬運。靈柩運抵嵐縣經賀家灣村時，已是深夜11時，一個老婆婆偕同兩個小女孩提著酒，捧著貢品，在寒風中佇立街頭等待祭奠有兩個小時。清晨，靈柩到赤尖嶺，村民湧出來，焚香叩拜，參加者達300多人。
14日下午8時，靈柩進入王獅村幹部早已出村相迎，街心擺好五個香案，村民700餘人跪拜祭奠。14日午夜1時到達東村，雖在夜間，街上擺好祭品，1500餘軍民，集會追悼，實驗學校同學爭相守靈。
4月18日中午，延安機場上莊嚴肅穆，各解放區和延安代表萬餘人來到機場，迎接為和平民主事業捐軀的烈士遺體。秦邦憲的夫人張越霞在人們的攙扶下也來到機場。
這幾天，她是在巨大的痛苦中度過的。她無法控制自己的感情，事情來得是這樣的突然，甚至連最後一面也見不到，最後一句遺言也沒有給她和孩子們留下來，她無法接受這個現實。眼淚模糊了她的視線，在人們的攙扶下，無力地等待著。
下午1時，兩架專機出現在機場上空，王若飛、秦邦憲、葉挺、鄧發等9位烈士的遺體在晉綏護靈專員譚政文的護送下，在延安機場降落。在風沙中等待已經數小時的人們，嚴肅的佇立在飛機艙門前面。烈士遺體從飛機上抬下來，人們脫帽致敬，整個機場沉浸在悲痛肅穆的氣氛中，在哀樂聲和輕微的抽泣聲中，烈士遺體在兩行持槍的護靈隊員的護衛下，緩緩地抬向靈堂。
抬靈隊經過祭場到達靈堂靜立在臺下，隨後，張越霞等烈士親屬在人們的攙扶下，走近自己的親人面前，做最後的告別。張越霞在秦邦憲的遺體前泣不成聲。周圍的人們也痛哭起來。是啊！秦邦憲走得太早了，革命正需要他的才華。秦邦憲走得太早了，他的孩子們都沒長大成人。入殮時狂風驟起，祭場周圍懸掛的挽幛孝幡等凌空飛舞，像是烈土們在天之靈有知。
