“拔管”风波持续一年后，台湾教育部门终于同意管中闵担任台湾大学校长。
据台湾“中央社”报道，台湾教育部门负责人叶俊荣12月24日宣布，“勉予同意”管中闵担任台大校长，但要求台大在3个月内针对此次校长遴选过程中的瑕疵和争议全盘检讨。
2017年6月，由于卷入台大教授郭明良论文抄袭风波，台大原校长杨泮池卸任。
2018年1月5日，台湾经济学者、“中研院院士”管中闵经台大校长遴选委员会投票，当选新任台大校长。原定管中闵2月1日正式上任，但台湾教育部门以管中闵担任企业独立董事、曾赴厦门大学兼职、涉嫌论文抄袭等争议为由，迟迟未核定该高校人事案。
4月27日，台湾教育部门宣布驳回人事案并要求台大重启遴选，但台大方面予以拒绝并提出司法诉愿。
因此，加上校长遴选前的6个月，有台湾岛内“第一学府”之称的台大在长达超过一年多时间没有正式校长 。其间，台湾教育部门也历经了两任负责人潘文忠、吴茂昆的先后请辞，现任负责人叶俊荣于2018年7月就职。
对此，有台湾舆论指出，由于管中闵在马英九执政期间曾担任发展规划主管部门负责人，被民进党等绿营人士认为“颜色不对”，因而遭到“绿营”持续“质疑”、“追打”和“抹黑”，百般阻挠其上任。
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