一、關於計提、繳納期限
何時計提，主要看主管徵收部門核定徵收期限。當然，如果按月計提，從會計核算上無疑是最準確的；只不過即使按月計提，繳納時按照規定期限即可。但通常來講，最長肯定不能超過一年計提。
二、適用會計科目
（一）按照目前會計政策要求，原先的“營業稅金及附加”科目修改為“稅金及附加”科目，核算範圍與之前差不許多（主要是增加了原先管理費用下的房產稅、土地使用稅、車船稅和印花稅），包括企業經營活動而發生的消費稅、城市維護建設稅、資源稅、教育費附加及房產稅、土地使用稅、車船使用稅、印花稅等相關稅費。而小企業會計準則與之相對應的“營業稅金及附加”科目列舉其核算範圍時，還包含了土地增值稅和礦產資源補償費、排汙費等項目。
殘疾人就業保障金與上述教育費附加和礦產資源補償費、排汙費等項目類似，可以通過“稅金及附加”或者“營業稅金及附加”（小企業會計準則）科目核算。
（二）通常，殘疾人就業保障金先計提、後繳納，可以通過“應交稅費——應交殘疾人就業保障金”過渡。
三、賬務處理
（一）計提殘疾人就業保障金
借：稅金及附加（小企業會計準則：營業稅金及附加）
貸：應交稅費——應交殘疾人就業保障金
（二）繳納
借：應交稅費——應交殘疾人就業保障金
貸：銀行存款
（三）直接減免
1、若全部減免，可以不必計提；
2、若部分減免，可以僅就減免後實際應繳金額計提。
3、若希望賬面反映減免金額，也可以先行計提，然後原分錄衝回。
借：稅金及附加（小企業會計準則：營業稅金及附加）
貸：應交稅費——應交殘疾人就業保障金
借：應交稅費——應交殘疾人就業保障金
貸：稅金及附加（小企業會計準則：營業稅金及附加）
鑑於直接減免特性，不宜結轉遞延收益、其他收益等科目。
（四）如果因為“多交”而退還
借：銀行存款
貸：應交稅費——應交殘疾人就業保障金
借：應交稅費——應交殘疾人就業保障金
貸：稅金及附加（小企業會計準則：營業稅金及附加）
若因為跨年度而多交退回，則將上述稅金及附加改為“以前年度損益調整”科目；同時，相應所得稅調整處理也是通過“以前年度損益調整”。調整完畢，將“以前年度損益調整”結轉“利潤分配——未分配利潤”，相應再調整盈餘公積等項目及相關報表項目。小企業會計準則採取未來適用法，不必做如上調整。
（五）如果屬於政策性“先徵後返”
借：銀行存款
貸：遞延收益、其他收益或者衝減稅金及附加、以前年度損益調整（後續調整同上；小企業會計準則計入“營業外收入”即可）
