1、病因治療：應注意日常營養和睡眠、運動的保障，精神心理性、慢性炎症性胃腸病、慢性腎病等患兒在相關因素被消除後，其身高增長會改善，甲狀腺功能減退患兒給予左甲狀腺素片治療。
2、生長激素替代治療：目前獲准採用生長激素治療的疾病有：生長激素缺乏症、先天性卵巢發育不全、Prader-Willi綜合徵、小於胎齡兒和特發性矮身材、短腸綜合徵等。自1985年重組人生長激素上市以來，生長激素用於治療生長激素缺乏症和各種非生長激素缺乏症的矮小症患兒得到了廣泛應用。目前的生長激素製劑有粉劑、水劑和長效周製劑三種，應根據患兒病情、家庭經濟情況在醫生指導下使用，長效生長激素每週注射一次，患兒更樂於接受，療效更好，青春發育後期或骨齡近閉合效果可能不理想，年齡越大費用越高，所以要早治療，療程通常不宜短於1～2年，可持續治療至骨骺閉合為止，家長不宜聞激素色變，生長激素是人體正常分泌的促進生長髮育的一種蛋白質，不同於糖皮質激素，在醫生的指導下使用是比較安全的。
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