藥理研究證實，板藍根對甲型流感病毒、乙型腦炎病毒、腺病毒等有抑制作用，但板藍根並不是流感萬能藥。2018年，國家衛健委發佈《流行性感冒診療方案（2018年版修訂版）》（以下簡稱方案），明確推薦了一批抗流感病毒藥物，但作為“抗病毒、預防流感”的明星藥板藍根卻不在推薦之列。方案中指出，中藥治療方面，在輕症辨證治療方案中，可用清熱解毒類中成藥。板藍根雖未列入方案中，但其確實具有“清熱解毒”的功效。
中藥和西藥的抗病毒概念不同，中藥有全身性調節作用，板藍根顆粒通過改善人體的內環境提高抗病毒的能力，注重身體康復的整體性和均衡性。無論普通感冒還是輕症流感，都是可以自愈的，流感本身是有一定病程的，也就是說大部分患者什麼藥都不用也可以自愈。不少輕症患者服用板藍根沖劑，滿足了感冒需要補充水分、提高體溫以促進排汗、對抗病毒的需求，加上適當休息，促進了自愈的進程。所以病好了未必是板藍根的作用，很大一部分是自身免疫系統的作用。
臨床醫生一般不會單獨開這一種藥，基本上是給患者開幾種藥加上板藍根一起服用。
預防性服用板藍根應當謹慎，人在健康狀態下過多服用板藍根，會傷及脾胃。藥物是用來治療疾病的，不能隨意服用。面對流感，合理作息，加強鍛鍊，提高身體抵抗力才是根本。
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